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par **A.B** » 11 Sep 2013, 16:56

Bonjour

J'ai une toute petite question à propos de la liaison hydrogène. Si on a un QCM du genre " la liaison hydrogène est possible entre H et R ", on compte cet item vrai ou faux sachant que les liaisons hydrogènes se font entre acides aminés polaires .. ou faut-il prendre en compte le fait que certains acides aminés sont donneurs et d'autres accepteurs et dans ce cas cet item serait faux ?

Merci :desire:

par **Kick-Ass** » 11 Sep 2013, 17:12

J'avoue que j'ai pas compris le sens profond de ta question, donc voila ce que je considere comme une liaison H

C'est un "pont ionique" entre l'oxygène du CO de la liaison amide et l'hydogène porté par le NH juste a coté de la liaison amide. Ca c'est pour la structure secondaire dont la stabilisation n'implique pas le R

Pour la structure tertiaire on retrouve aussi des liaisons H, donc entre les chaines latérales R. Les liaisons se font avec les élements de l'eau présente autour, ou par exemple avec un H porté par un groupement NH3 des chaines latérales

par **A.B** » 11 Sep 2013, 18:13

En fait, je te prend un exemple provenant de l'annatut : " Une liaison hydrogène peut se faire entre N et K " et " Une liaison hydrogène peut se faire entre C et D " . Ces deux items sont comptés vrais car ce sont tous des acides aminés polaires.
Mais si on avait H et R par exemple au lieu de N et K pour le premier item , est-ce que cet item reste vrai ? ( parce que HKR sont des acides aminés accepteurs de H+ et du coup pour que la liaison puisse se faire il faudrait un AA accepteur de H+ et l'autre donneur de H+ non ? )

En espérant que ça soit compréhensible :angel:

par **Kick-Ass** » 11 Sep 2013, 18:52

Okay je vois ^^

Ben ecoute la réponse est selon moi très simple et pas du tout prise de tête:
Les liaisons hydrogènes sont présentes dans les structures tertiaires (celles dont tu parles) mais aussi dans les secondaiiires (entre les chaines principales)
DONC tu peux très bien faire une liaison H entre n'importe quel acides aminés si tu pars du principe qu'ils sont dans une hélice alpha avec un écart de 4 AA évidemment.

C'est pourquoi je pense que le QCM est mal formulé.

Mais bon, c'est un peu facile donc:

Si tu précise dans une structure tertaire peut-on faire une laison hydrogène entre H et R la par contre je dirais non. En effet dans les exemples du QCM du tut il y a a chaque fois une double liaison O qui représente le groupement accepteur. Entre H et R 2 groupements donneurs, pas d'accepteur dans la chaine secondaire je précise. Donc je dirais faux dans ce dernier cas