Exception de la Proline

[Polo]

Bonsoir à tous !
J'ai une question par rapport à l'exception de la Proline.
Dans le cours il est bien spécifié que la Proline ne peut pas être inclue dans les hélices de la structure secondaire. De plus, il est indiqué que les protéases liées à la structure primaire sont inactives si la liaison peptidique est associée à un résidu Proline. Or, les Proline sont présentes dans les coudes Béta car elles leur apportent cette forme. Peut être que j'ai mal compris mais les proline seraient présentes uniquement pour les coudes Béta de la structure secondaire des protéines ?
Désolé pour le pavé

[Kick-Ass]

Chalut !

Mon opinion:

La proline comme les 19 autres AA sont inclus dans la séquence primaire. Cependant, elle n'est pas inclue dans les structures secondaires comme les hélices alpha ou feuillets beta. Elle est inclue dans ce que le prof appelle les structures supra-secondaires, à savoir les coudes béta.

Donc en gros y'aura pas de feuillet béta / hélice alpha dans les portions protéiques ou sera présente ladite proline.

Elle est toutefois présente dans la structure primaire, même si les protéases sont inactives sur les liaisons formées avec une proline.

[daphné]

bonsoir!

kick-ass t'a bien répondu (merci au passage!)

attention à ne pas confondre structure secondaire (hélice alpha, feuillet bêta) et structure supersecondaire (coude bêta)

au niveau de la proline, il est très rare de retrouver une proline dans une structure secondaire en hélice alpha ou en feuillet bêta, car si on a une proline dans la séquence d'AA (c'est-à-dire dans la structure primaire), du fait de sa forme particulière, on aura du mal à mettre en place une structure secondaire en hélice alpha ou en feuillet bêta. la forme de la proline induit un changement de direction de la chaîne peptidique incompatible avec la structure de feuillet ou d’hélice.
d'ailleurs si par un phénomène quelconque (mutation,...) une proline se retrouve dans une zone d'hélice ou de feuillet, on peut considérer que sa structure sera altérée : on aura un feuillet/hélice tout moche qui peut conduire à une altération de la fonction de la protéine

par contre dans les coudes bêta (structure supersecondaire) on a toujours une proline en position 2, justement parce que la forme "bizarre" de la proline permet de mettre en place un coude, et donc de faire un changement de direction de la chaîne.
dans les coudes bêta (structure supersecondaire), la proline est indispensable (de part sa fameuse forme qui permet la mise en place du coude)


est-ce que c'est bon pour toi?

[Polo]

Oui tout est bon merci beaucoup !