help pKa !!

[*Ptitnanane*]

Bonjour, j'arrive plus à comprendre une chose qui me paraissait logique avant :
On dit que le pKa correspond à la valeur du pH où 50% de la forme de l'AA sera protonnée et 50% déprotonée.(c'est bien ça?)
En dessous de ce pH on aura la forme protonée et au dessus la forme déprotonnée.
On a ensuite un exemple avec le pKa du COOH=2,2
On nous dit que si le pH monte jusqu'à 4 On aura NH3+ et COO- donc la somme des charge sur l'AA =0
Hors on est pas censé être sous la forme déprotonée de l'AA une fois avoir dépassé les 2,2 ??
Et à pH=4 on a dépassé la valeur du pH 2,2 critique du COOH (donc on est sous forme déprotonné d'après la définition ci dessus)
et on a pas atteint celle du NH3 (pKA~9,5) donc on est sous la forme protonée EN MÊME TEMPS ?!

Helppp j'ai l'impression de tout confondre....

[daphné]

bonjour!

alors attention un pKa concerne un couple acido basique, pas l'AA entier!
on va parler du pKA de la fonction amine, du pKa de la fonction acide-carboxylique, et du pKa d'un éventuel groupement ionisable pour la chaîne latérale.

pour une fonction, un couple acide base: le pKa correspond effectivement à la valeur de pH pour laquelle on a 50% de groupements sous forme protonée, et 50% sous forme déprotonée.
par exemple si pKa(NH3+/NH2) = 9, pour pH=9 on a 50% de groupements sous forme NH3+ et 50% sous forme NH2

on ne peut pas parler de pKa pour un AA, on peut juste parler du pHi (point isoélectrique) qui est le pH pour lequel la forme zwitterionique de l'AA (c'est à dire l'AA avec une charge globale nulle) prédomine

est-ce que c'est plus clair pour toi?

[*Ptitnanane*]

OUIIII Merciii j'avais tout mélangé
et au passage une autre ptite question de Bioch' : comment eskon peut savoir quels pKa on doit additionner pour le calcul du Point isoélectrique, lorsque la chaîne latérale est ionisable?

[daphné]

il faut regarder les valeurs de pKa qui entourent la forme zwitterionique (charge nulle)

prenons l'exemple de l'aspartate:

tu dois prendre en compte trois couples acido-basiques:
- la fonction amine (pKa = 9,9)
- la fonction acide carboxylique (de la structure de base des AA) (pKa = 2,3)
- la fonction acide carboxylique de la chaîne latérale (pKa = 3,9)

tu classes tes pKa par odre croissant, et tu regardes entre chaque valeur de pKa quelle est la charge globale de ton AA:
donc là par ordre croissant tes pKa ça donne 2,3 / 3,9 / 9,9
- pour un pH < 2,3: la fonction amine est sous forme NH3+, les deux fonctions acide carboxylique sont sous forme COOH: la charge globale de l'AA est + 1
- pour un 2,3 < pH < 3,9: la fonction amine est sous forme NH3+, la fonction acide carboxylique reliée au carbone central est sous forme COO-, la fonction acide carboxylique de la chaîne latérale est sous forme COOH: charge globale 0 (forme zwitterionique)
- pour 3,9 < pH < 9,9: la fonction amine est sous forme NH3+, les deux fonctions acide carboxylique sont sous forme COO-: charge globale -1
- pour 9,9 < pH: la fonction amine est sous forme NH2, les deux fonctions acide carboxylique sont sous forme COO-: charge globale -2

donc tu vois que les pKa entourant la forme zwitterionique sont 2,3 et 3,9
donc pHi = (2,3 + 3,9) / 2 = 3,1 (dans le poly le prof trouve 2,8 parce qu'il a pris 2 comme valeur pour pK1, et non 2,3)

c'est bon pour toi?

[*Ptitnanane*]

Désolée de répondre 10 ans après, oui c'est bon pour moi !
Et merciii bcp pour tes explications si bien détaillées I TUTEURS !