Séquence redondante glycoprot

[Kick-Ass]

Hi!

En cours d'après ce que j'ai compris dans les glycoprots pour la liaison N-glycosamine on avait toujours une premiere N-acetyl galactosamine qui faisait la liaison, une seconde N A G, puis 3 manoses et ensuite ramification.
Je ne suis pas arrivé à comprendre ce qu'il disais pour la liaison O-glycosidique (sachant qu'il était en vitesse x2 ce matin..) j'aimerai savoir s'il mentionnait le meme type de séquences répétitives.

Thanks !

[ClaireK]

Hey

Oui, d'après ce que le prof a dit, que ce soit une liaison O-glycosidique (sur SER/THR) ou une liaison N-glycosidique (sur ASN): la première liaison est sur une N-acétyl galactosamine dans les 2 cas!

[Kick-Ass]

Hey, merci pr la réponse =)

Donc on apprend juste le premier sucre effectuant la liaison est une N A G dans la liaison O glycosidique et N glycosamine c ca ? :p

[ClaireK]

Ben comme tu dis, pour la liaison N-glycosidique, il y a 2 NAG puis 3 mannoses puis les ramifications, mais pour la liaison O-glycosidique, j'ai juste noté la NAG en premier, et je ne suis pas sûre de la suite, le prof a vraiment speedé je crois que c'est tout avant les ramifications.
il nous reste plus qu'à attendre la ronéo ou un gentil tut

[daphné]

bonsoir!

alors pour moi il peut y avoir soit un N-acétylglucosamine soit un N-acétylglycosamine au niveau de la liaison! j'avoue que ce n'est pas une partie que le pr. détaille énormément, et que l'on trouve des choses un peu différentes selon les sources.. à l'occasion on en reparlera avec le pr. mais sachez qu'à mon avis ce n'est pas le plus important sur cette partie, il faut surtout bien savoir quel type de liaison on a (amide-sucre, OH-sucre) et avec quel AA (N, S, T)

j'espère que c'est bon pour vous

[ClaireK]

Ok c'est bon pour moi (et si vous avez l'occasion de demander quelques précisions au prof, ce serait top magnifique )
Merci Daphné!

[daphné]

bonjour!

on a posé la question au pr., il nous a bien reprécisé les choses, donc apprenez ça: http://www.carabinsnicois.fr/phpbb/viewtopic.php?f=482&t=37220#p249456

il faut retenir les deux types de liaison et leur caractéristiques:
- liaison N-glycosamine: entre le carbone anomérique d'un N-acétylglucosamine (GlcNAc) et le N d'une Aspargine (N)
- liaison O-glycosidique: entre le carbone anomérique d'un N-acétylgalactosamine (GalNac) et le OH d'une Sérine (S) ou d'une Thréonine (T)
en ce qui concerne la structure avec les trois mannose & co., elle n'est pas à connaître (on laisse ça à la Biocell'!)
et le pr. va corriger une mini coquille sur le schéma de droite: le carré "GalNac" en bas à droite est censé être jaune (et non bleu)

[Kick-Ass]

Thx daphné ca simplifie un peu la chose :p