Aspartate dans l'helice alpha

[Gnafron]

Zalut !!!
Ze suis tombé sur qcm qui me compte vrai l'item suivant : " D(aspa) n'est jamais retrouvé dans l'hélice alpha"
Bah pour moi c'est faux, guidi aurait dit qu'il était simplement défavorisé, mais pas refusé dans l'hélice alpha
Vous en pensez quoi vous ??

[YeppaaaH]

salut

ouai je pense comme toi mais a mon avis guidi posera pas de question sur ça c'est trop subtile.

je pense qu'il faut retenir le fait qu'une proline désorganise une hélice alpha

mais bon la réponde d'un tut serai bien

[daphné]

bonsoir!

alors dans le cas où ces AA chargés sont représentés dans la protéine, étant donné que les liaisons ioniques sont plus fortes que les liaisons hydrogène, l'hélice sera mal formée, elle va être perturbée par les liaisons ioniques qui vont la contraindre et lui faire adopter une mauvaise conformation.

pour en revenir à ton item, d'où sort-il? je ne pense pas qu'il pourrait tomber tel quel au concours car il est formulé de manière trop ambiguë..

[Gnafron]

Yepaaa, je pense que la proline ne se trouvera jamais dans une helice alpha
Par exemple, un item : "la pro desorganise l'hélice alpha" pour moi est faux
A vous de juger

[Nikoulas]

Salut Gnafron, je pense qu'un tel item serait juste vu que diapo 65 le prof dit bien la présence d'un résidu proline perturbe l'organisation d'une alpha-hélice

[Gnafron]

Et il l'a compté juste sur le diapo, sauf qu'à l'oral, il l'a compté faux a cause de la raison que j'ai énoncé ci dessus

[Léa_]

Salut Gnafron !

On a déjà prévu d'en parler au prof vu qu'il y a une discordance entre ce qu'il a dit et ce qui est écrit sur son diapo. Mais l'item que tu as énoncé est bien vrai.

[daphné]

bonjour!
réponse du pr. sur ce lien: http://www.carabinsnicois.fr/phpbb/viewtopic.php?f=482&t=37220&p=249456#p249456

- on ne retrouvera jamais de Proline (P) dans une hélice alpha (car elle ‘‘casse’’ l’axe de l’hélice)
- on pourra retrouver des AA chargés dans une hélice alpha : ils seront en très faible proportion (car ils en altèrent l’organisation) , mais ils pourront quand même être présent pour assurer divers rôle (faire des liaisons ioniques avec d’autres segments de la protéine par exemple)

[Gnafron]

donc donc donc mon item "la proline désorganise la structure alpha des protéines" est bien FAUX !!
N'est ce pas ?

[Happiness]

Pour revenir a la première question,le prof ce matin nous a bien expliqué qu'il pouvait y avoir des aa polaire chargé certes en quantité très faible mais c'était possible. Donc l'item serait faux, il peut y avoir un aspartate dans l'hélice alpha. Pour la deuxième question, la proline ne peut STRICTEMENT se trouver dans la séquence d'une helice alpha mais peut se retrouver entre une séquence de type hélice alpha-proline-hélice alpha. Voilou

[Gnafron]

Oui voilà, c'est ce que le prof a dit !
Mais mon item sur la proline est juste pour Daphné, or moi je le trouve faux !
D'autant plus avec ce qu'il a dit aujourd'hui !

[Léa_]

Mais non l'item est juste Gnafron : on ne peut pas trouver de proline dans l'hélice alpha justement parce que cette proline destructure totalement l'hélice !

[Gnafron]

Léa, si ce n'est pas trop te demander, tu peux poser la question au prof car j'ai un énorme doute :/
Je veux bien te croire mais je n'y arrive pas XD
Mais certe tu as raison au sujet de la proline que déstructure tout !
Mais l'item sous entend qu'il y a possibilité d'avoir une proline dans l'H-alpha et Guidi a fait un piege dessus la dernière fois et je veux pas me retrouver face à face au concours et douter !
Merci si tu le fais sinon, merci quand même ^^

[Léa_]

Gnafron, si c'est trop me demander : la question à déjà été posée au prof (cf message de Daphné), la je pense que tu vois un sous entendu qui n'existe pas. Si tu ne me crois pas alors que j'ai la réponse du prof à l'appui, je ne vois pas bien ce que je peux faire de plus...

[Gnafron]

Ok