Structure du cours identification de cible moléculaire

[Avendil]

Salut !

Alors dans le cours 4 je suis un peu perdu au niveau de la structure / sous parties, est-ce qu'on a :

++A partir de la connaissance d'un Processus physiopathologique :
Modélisation moléculaire (une des possibilité des ce grand titre et la seule traitée), qui se divise en :
1) Identification de la cible moléculaire
2) Relation structure / activité

Merci d'avance pour votre aide !

[Kick-Ass]

Salut !
C'est vrai que le plan est assez bizarre, voila comment je vois les choses:

Une fois que tu as identifié ta cible en avant projet, c'est à dire en gros le secteur dans lequel tu vas lancer la recherche, tu commences le projet dont le but ultime sera de trouver 2 ou 3 molécules vraiment actives que tu va breveter pour passer en pré-clinique.

Pour trouver cette molécule, plusieurs solutions:

1) Le hasard : par exemple par la découverte d'un EI :Tu utilises un médicament pour une indication en te rendant compte qu'il agit sur sur autre chose, du coup tu va pousser l'investigation (exemple avant le viagra était utilisé comme anti hypertenseur, et puis on s'est rendu compte que..)

2) Tu pars d'un processus physiopathologique : derrière ce nom barbare, cela veut simplement dire que tu pars de la pathologie, par exemple tu prend un animal hypertendu, et tu testes des molécules dessus en espérant qu'une d'entre elle puisse agir sur cette pathologie. C'est plus fréquent

3) A partir de la connaissance d'une cible moléculaire: C'est une investigation très précise, ta molécule sera uniquement active sur cette cible. Pour cela tu dois tout d'abord
a) Identifier la cible moléculaire (attention, c'est différent de l'avant projet ou tu identifiait une cible générale pour laquelle tu lanceras ta recherche). C'est surtout utilisé en cancéro, en étudiant le génotype d'une cellule cancéreuse, tu trouves un gène sur-exprimé qui code pour un récepteur, ce qui impliquera son rôle pathologique. Tu as donc trouvé ta cible, maintenant tu vas essayer de trouver une molécule pour la bloquer, donc
b) modèlisation moléculaire, ou RSA (relation structure activité) de ta molécule: Concept de la "clé serrure", tu as trouvé ta cible qui est ton récepteur, tu va chercher "in sillico" (c'est à dire dans une base de donnée) une molécule ayant les caractéristiques compatibles avec le blocage de ce recepteur.

On va dire que tu trouve quelques milliers de molécules compatibles, tu va ensuite passer par les étapes de screening, puis selectionner les meilleurs des meilleurs des meilleurs (MIB = molécule in black) pour les breveter et ainsi passer en pré-clinique.

Voila :p

[Avendil]

Génial merci beaucoup !

Et du coup juste petite précision : La modélisation moléculaire (donc à partir d'une cible moléculaire) ne fait donc pas partie de la "découverte à partir d'un processus physiopathologique" mais est quelque chose à part entière ?

[Kick-Ass]

J'ai l'impression qu'elle différencie bien les 2 dans la ronéo, même si elle ne développe pas trop la connaissance du process physio-path, ca me semble être bien + général qu'à partir de la connaissance d'une cible moléculaire qui est vraiment de la recherche très ciblée, et d'après ce que j'ai compris ce sont vraiment 2 types de découvertes à part entière ^^

Attendons l'avis des tut !

[Raffio]

Salut

En fait quand tu tentes une recherche de molécule à partir la connaissance de processus physiopatho, tu cherches une molécule capable d'agir sur une des enzymes (par exemple) participant à un processus. La modélisation moléculaire c'est un des moyens (le principal) d'y arriver

Ex : Tu sais que les Rc Beta adrénergiques augmentent le rythme cardiaque en présence d'adrénaline, ben tu cherches à bloquer ces Rc dans les tachycardies (et là tu as crée les Betabloquants). Tu vois ?

[Kick-Ass]

Salut, merci pr ta rep Raffio, cependant j'avais compris que les 2 étaient des modes de découvertes vmt différents :/

Dans son diapo la prof explique que la découverte en partant d'un process physiopath est en gros le fait de prendre un modèle cellulaire, d'organe isolé ou animal developpant un processus physiopathologique connu et de tester un grand nombre de molécule dessus, un peu à l'aveugle pour essayer de trouver une molécule qui agirait sur ce processus. D'ailleurs dans sa diapo 16 concernant la découverte par connaissance du processus physiopathologique, il est marqué

Processus physiopathologique (criblage, ou Screening primaire) Exemple : Screening de banques de composés chimiques sur des cellules cancéreuses

Cela est donc pour moi à différencier de la découverte par connaissance d'une cible moléculaire, qui est plus récente et beaucoup plus ciblée que cette dernière :/

Peut-être que je me trompe, mais j'avais vmt l'impression qu'elle différenciait les 2 ^^

[Raffio]

Re

Mes co-tuts sont d'accord avec ma version à priori, cependant l'an dernier elle séparait davantage les 2 trucs donc la distinction entre les deux, donc si elle se contredit d'une année sur l'autre ça doit pas lui importer tant que ça ^^

[Avendil]

D'acc alors on retient que c'est groupé ! Merci
J'attends de voir pour Kick si c'est bon puis je passerai en résolu si c'est ok.

[♦MC♦]

Pour ce que ça vaut, j'aurais tendance à aller dans le sens de soeur kick-ass.

Le ciblage moléculaire permet d'éviter les étapes de screening, c'est tout l'intérêt de la modélisation moléculaire. On connaît déjà notre cible moléculaire (Rc / Enzyme...), on fait une modélisation assistée par Ordi pour retrouver la molécule la plus adéquate, on a direct notre PA à améliorer...

Dans le cadre du processus physiopathologique, pour moi c'est justement les étapes de screening.

[Quiche]

Salut

Moi aussi, je serais plutôt de l'avis de Kick... Est ce qu'il serait possible de lui poser la question s'il vous plaît

[Marine-83]

Salut !

Alors en regardant la diapo et la ronéo, je ne vois pas où tu as trouvé ce que tu as écrit dans ton premier post Avendil ?

Parce que pour le coup en fin de compte la version de la diapo et de la ronéo sont les mêmes et je pense qu'elles sont bonnes (désolée pour les petits cafouillages ), et je trouve qu'il n'y a pas d'ambiguités

[Avendil]

Ce que j'ai écrit est une tentative d'exprimer ce que j'avais compris à la base en lisant la ronéo et la fiche, à savoir que la modélisation moléculaire est un procédé appartenant à la production à partir de la connaissance d'un Processus physiopathologique, mais ça me paraissait un peu étrange j'ai donc fait un post. L'explication de Kick me paraissait plus logique (à savoir : ce sont deux choses distinctes), mais d’après Raffio ça appartient bien à la production à partir de la connaissance d'un Processus physiopathologique.

Après j'ai pas trop bien compris où on en est là dessuite