PAGE et traitement au SDS... Vraiment concluant ?

[kinésine]

Coucou tout le monde !

Ce matin pendant le cour de bioch j'ai essayé de visualiser certaines situations dans lesquelles on pouvait se trouver après tout ce "mauvais traitement" infligé à nos protéines...

Le principe PAGE amènerait donc à faire migrer des protéines ou portions à travers le gel, les plus grosses bloquées se retrouveraient en haut alors que les plus petites se faufileraient plus vers le bas. OK.

On sait également que vers le bas on retrouverait (si je ne m'abuse) l'anode chargée positivement, elle aurait donc plus tendance à attirer les charges -

Mais si on applique un traitement dénaturant avec le SDS, plus la protéine sera grosse, plus elle sera chargée négativement, donc se rapprocherait de l'anode, donc migrerait vers le bas, non ?

Je ne comprends pas comment dans ces conditions on peut coupler SDS et électrophorèse alors que ces deux phénomènes devraient s'interférer...

Merci de m'éclairer

[BOB]

Haha fallait y penser a ça ^^

Écoutes d'après ce que j'ai compris le SDS permet de neutraliser toute les charges de la prot et de lui conférer une charge globale négative (ça tu l'a compris) mais toute les protéines seront logé a la même enseigne concernant cette charges du coup elle n'influencera pas la
Migration dans le cas de cette electrophorese et la force du gel sera beaucoup plus importante que la charge c'est pour ça qu'on fait migrer les prot seulement en fonction de leur taille (sinon la charge jouerait aussi un rôle, ce qui n'est pas le cas)

En plus si tu compare a l'electrophorese bi dimensionnelle qui trie dans un premier temps en fonction de la charge, elle joue sur le phi, et la prot ne s'arrête pas tant qu'elle est pas sous forme zwiterionique. Ici si la charge jouait son rôle, alors la migration ne s'arrêterait pas tant que toute les protéines n'aurait pas atteint l'anode (ce qui serait pas très très utile)

[kinésine]

Je vois en fait le SDS c'est simplement pour ne tenir compte que de la taille des protéines si j'ai bien compris, une sorte de neutralisation en fin de compte...

On a besoin d'un champ électrique pour accélérer la migration des protéines mais en fait il ne joue un rôle que mécanique et pas sélectif !


Je pense que je vais passer en résolu si aucun tuteur ne nous contredit d'ici quelques jours
Merci pour ta réponse BOB !

[BOB]

Ouiii ! C'est exactement ça ! Y a pas de quoi

Attend qu'un tuteur passe par la on sait jamais, ça devrait pas tarder de toute manière

[Radagast]

Salut!

Effectivement pour le traitement au SDS-PAGE, le SDS met toutes les protéines "sur le pied d'égalité" pour que ce ne soit que leur taille qui soit discriminante

Merci à BOB!

Bon courage à vous

[BOB]

Merci