CpG vs îlots CpG

[Hamlet]

Bonjour

Ronéo 12 p 5 : "CpG (mauvais) =/= îlots CpG (bon)". J'ai pas bien compris ce que cela signifiait, si l'on pouvait me l'expliquer ce serait top.

Merci !

[levure]

Salut!

Ça veut tout simplement dire qu'il ne faut pas confondre le dinucléotide CpG et les îlots CpG qui est une succession d'énormément de CpG

Par exemple :

Dinucléotide CpG : ATACCACGCATTG
Ilot CpG : ATACCACGCGCGCGCGCGCGCGCGCG[...]CGCGCGCGCGCGCGCATTG

[Hamlet]

Ok, encore une précision

À la même page :
"98 % du génome qui n'a pas beaucoup de CpG et qui sont pour la plupart méthylés."
"Nos gènes importants, eux (environ 2 %), s'expriment fortement (ils ne sont donc pas méthylés) et sont regroupés sous forme d'îlots CpG."

Est-ce que cela signifie :
-> les dinucléotides CpG sont spécifiques des 98% du génome.
-> les îlots CpG sont spécifiques des 2% du génome.

Encore merci !

[djuly]

Bonjour

Je m'incruste parce que ça m' intérresse aussi,au fait c'est les parenthèses "mauvais" et "bon" qui me perturbent,je comprends la différence entre les ilots CpG et les CpG mais je comprends pas pourquoi CpG (mauvais)et ilot (bon)
Merci d'avance

[Retrojex]

Je m'incruste aussi, car je ne comprends pas pourquoi on parle de séquence répétée CpG qui sont mauvaise donc méthylée.

Mais alors si c'est des séquences répétée CpG, qu'est-ce que les ilots CpG_{(si c'est pas des séquences répétées CpG)}?

[levure]

Séquence répétée CpG et ilôt CpG c'est pareil!

Dans 98% du génome, il y aura des ilôts CpGmais ils sont très peu nombreux et ils seront méthylés, ce qui correspond à une restriction de l'expression des gènes 98% de notre génome est non transcrit

Dans les 2% restant, les ilôts CpG sont nombreux, on en trouve beaucoup et on en retrouvera beaucoup sous forme non méthylée, ce qui correspond à une facilitation de l'expression des gènes 2% de notre génome peut être transcrit

EDIT : RECAP

[Hamlet]

Good !! Merci

[Retrojex]

Parfait aussi !! merci

[levure]

Désolé je up le post parce que finalement on parle pas d'ilôt CpG pour les CpG méthylés dans 98%du génome (version de la diapo du prof)
désolé pour l'erreur, le principe reste le même c'est juste qu'on utilise pas le terme "ilôt CpG"

[Hamlet]

Merci !