Nucléosome et réplication

[melatonine]

Re-bonjour !

Est-ce que quelqu'un sait pourquoi les nucléosomes sont répartis de manière aléatoire sur les molécules d'ADN filles (après la réplication) ?

Cette phrase me perturbe

L'environnement épigénétique n'est pas censé perdurer au fil des réplications, voire même transmis à la descendance .. ?

Merci d'avance

[levure]

Re-salut

Au départ on a une répartition aléatoire des nucléosomes (juste après la réplication) mais on va vite avoir intervention de DNMT1 qui va méthyler les brins d'ADN néosynthétisés de la même manière que les brins parents
Ainsi on va reproduire une structure chromatinienne identique pour les 2 cellules filles que pour la cellule mère car on aura la même méthylation de l'ADN

[melatonine]

Coucou levure !

Je suis désolée mais je ne comprends pas.. Ça voudrait dire que seule la méthylation a un impact sur la structure chromatinenne et pas la position des nucléosomes ? (Pourtant avec le Chip etc on voit bien que c'est pas le cas non ? )

Merci d'avance

[levure]

Une fois la méthylation mise en place on va avoir une restructuration de la chromatine (et donc des nucléosomes qui étaient initialement répartis aléatoirement) pour qu'elle corresponde à la marque épigénétique (méthylation)

En fait à la base les nucléotides se répartissent aléatoirement parce qu'on a pas de marque épigénétique complète mais une fois qu'on a méthylé notre ADN, on peut mettre en place la structure chromatinienne finale

[melatonine]

En fait j'ai du mal à fairer le lien entre méthylation de l'ADN (phenome plus global..) et les modifications épigénétiques des histones car justement on nous dit de bien faire la différence entre les deux en plus

désolée pour toutes ces questions pas très précises

[levure]

La méthylation de l'ADN (méthylation directe d'un nucléotide, ≠ méthylation d'une protéine histone) va servir de code pour savoir quelles modifications sont à faire au niveau des histones et donc comment organiser la chromatine.

Si l'ADN est méthylé (au niveau d'un ilôt CpG), il sera reconnu par une protéine qui va recruter des histones désacétylases et des histones méthyltransférase desacétylation et méthylation des histones (H3K9+++) condensation de la chromatine

Lorsqu'une cellule se divise, on veut que les cellules filles gardent le même programme transcriptionnel que la cellule mère (on veut qu'elles expriment les mêmes gènes) par exemple quand un lymphocyte se divise, on veut obtenir 2 lymphocytes, on veut pas obtenir 2 cellules qui expriment n'importe quoi
On va donc méthyler l'ADN exactement de la même manière que l'ADN de la cellule mère. Cette méthylation sera reconnue HD, HMT... condensation ou pas de la chromatine en fonction de la méthylation de l'ADN


- Quand on réplique l'ADN (phase S) on va avoir méthylation de l'ADN au niveau de certains ilôts CpG. Cette méthylation se fera au niveau des gènes qu'on ne veut pas exprimer car la méthylation entraîne une condensation de la chromatine. La méthylation de l'ADN entraînera la désacétylation et la méthylation des histones, ça entraînera donc un changement de conformation de la chromatine.

- Hors de la réplication, quand on veut transcrire des gènes, on va avoir fixation de facteurs de transcription qui vont pouvoir recruter des histones méthyltransférases, histones acétyltransférase, histone desacétylases etc en fonction de si on veut activer ou inhiber l'expression d'un gène modification directe des queues N-term des histones et non de l'ADN.
(Quand on induit des modifications post traductionnelles des histones, on peut également modifier la méthylation de l'ADN pour transmettre le caractère épigénétique au fil des générations)


En gros:
La méthylation de l'ADN sert à transmettre d'une cellule mère à une cellule fille la même structure chromatinienne
la méthylation de l'ADN entraîne la méthylation et la désacétylation des histones
la méthylation (H3K9) et la désacétylation des histones entraînent le changement de conformation de la chromatine
le changement de conformation de la chromatine entraîne la modification de l'expression des gènes...

Est ce que c'est plus clair?

[melatonine]

Oui c'est beaucoup plus clair, merci beaucoup !


Par contre je pensais qu'il n'y avait pas de methylation de l'ADN au niveau des îlots CpG ?



Mais c'est sûrement plus compliqué que ça

[levure]

Dans 98% du génome, les ilôts CpG seront méthylés et donc on aura pas d'expression des gènes dans ces zones.

Dans les 2% restant, on va faire varier la méthylation pour réguler l'expression des gènes.
Si on ne méthylait pas l'ADN, au final tous les gènes s'exprimeraient et c'est pas ce qu'on veut, on veut avoir des cellules spécialisées donc avec un programme transcriptionnel bien précis

On a donc bien une méthylation de certains ilôts CpG

viewtopic.php?f=620&t=60289

[melatonine]

En fait je me basais sur la ronéo 12 page 5, qui faisait bien la différence entre CpG et îlots CpG ahah. Mais je viens de voir pleins de posts à propos de ça tu as déjà dis pleins de fois que c'était pareil donc désolée et MERCIII (pour ta patience)