Îlots CpG

[caféine]

Bonjour bonjour !

Alors voila je ne comprends pas trop comment on peut dire que les îlots CpG sont sous-représentés dans 98% du génome humain...

En soi c'est des nucléotides, donc de l'ADN, donc (même si les niveaux de compactions sont différents, tout comme les modifications des histones) on a dans chaque cellule le même code génétique, ce qui signifie les mêmes dinucléotides CG.
En ce sens comment peut on dire que ces îlots ne sont normalement représentés que dans 2% de l'ADN, sachant qu'ils sont en amont des gènes actifs, et que certains gènes seront actifs chez certaines cellules et pas chez d'autres ?

Je sais pas si c'est compréhensible, je peux essayer de reformuler au besoin :p

Merci d'avance !

[MrCitron]

Salut Caféine

Attention il y a une distinction à faire entre les îlots CpG et les dinucléotides CpG, ce n'est pas du tout la même chose. Je te renvoie au récap qui a été fait l'année dernière par le tuteur Levure (<3) juste ici

C'est bon pour toi? Bonne journée

[caféine]

J'ai encore du mal... Les dinucléotides au final ils vont être plutôt concentrés dans certaines zones de l'ADN identiques pour chaque cellule non ?

[MrCitron]

En effet dans 2% du génome tes dinucléotides CpG vont être concentrés d'une telle façon que l'on parle d'îlots CpG, ils sont retrouvés en amont des séquences promotrices des gènes mais attention ce n'est pas parce que tu as un ilôts CpG en amont d'un promoteur que ce gène sera forcément transcrit en ARNm, en effet il y a tout un tas de mécanisme de régulation (enhancer/silencer ...) qui eux déciderons de quel gène est transcrit.

C'est bon pour toi?

[caféine]

Ahhhh d'accord ! Mais pour le reste du génome du coup ?

[MrCitron]

Dans le reste de ton génome tu auras juste des dinucléotides CpG sous-représentés et méthylés qui eux auront pour rôle de former de l'hétérochromatine

[caféine]

D'acc! merci beaucoup