Hey !
Alors c'est une partie du cours un peu délicate à comprendre, je vais essayer d'être le plus clair possible
Au niveau d'une fourche de réplication, l'hélicase n'avance que dans un sens, qui sera le même pour les deux brins parents que l'on sépare
Ici on s'intéresse à la fourche
gauche d'une bulle de réplication : l'hélicase avance donc de droite à gauche (ce qui correspond au sens global de progression de la fourche).
Tu remarques que
les deux brins parents (en bleu foncé) sont
antiparallèles entre eux, mais aussi que
les brins fils (en bleu clair) sont eux aussi
antiparallèles par rapport à leur brin parent respectif (en gros,
les brins parents sont antiparallèles et
chaque brin fils est antiparallèle avec
un brin parent).
On va s'intéresser au brin du haut, le
brin direct donc : l'ADN polymérase avance de droite à gauche, comme l'hélicase. L'hélicase passe en premier, elle aura donc eut le temps de défaire la double hélice pour séparer
les brins parents avant que la polymérase ne vienne et commence à synthétiser
le brin fils dans le même sens (de droite à gauche donc car on ne synthétise
le brin fils que de son extrémité 5' vers son extrémité 3').
Attention, c'est l'orientation du
brin fils qui dicte le sens de déplacement de la polymérase, de
5' en 3' TOUJOURS par rapport au
brin fils UNIQUEMENT (le brin parent est orienté en sens inverse mais ne t'en occupe pas).
On dit donc que "par rapport à la progression de la fourche, un brin (direct) est correctement orienté pour être synthétisé dans le sens 5’-3’ à partir d’une seule amorce" (phrase du diapo).
Mais tout ça, ce n'est valable que pour le brin direct (c'est à dire le brin du haut dans cet exemple) !
Sur le brin du bas c'est un peu différent, pourquoi?
Déjà l'hélicase avance toujours dans le même sens au niveau de cette fourche (c'est-à-dire de droite à gauche) mais je te rappelle que tous les brins sont
antiparallèles entre eux ! Le
brin fils du bas est donc orienté dans le
sens opposé à celui du
brin fils du haut (au niveau du brin direct donc).
L'ADN polymérase doit par contre toujours copier dans le sens 5'-3', sauf que au début de la réplication, la double hélice n'est pas encore totalement ouverte, et le tout début du
brin fils (là où la polymérase devrait commencer son travail) est inaccessible ! Mais la polymérase n'attend pas que les deux brins soient totalement séparés pour commencer à synthétiser ce
brin fils. La polymérase alpha va donc synthétiser une première amorce dès qu'elle peut pour ne pas faire attendre l'ADN polymérase (sur le schéma tu ne vois que l'extrémité 3' du
brin fils du bas, son extrémité 5' est supposée être tout à gauche, là où
les brins parents sont encore attachés).
L'ADN polymérase va alors commencer son travail dans le
sens 5'-3' par rapport au brin fils, c'est-à-dire de gauche à droite
uniquement, elle ne peut pas aller de droite à gauche (
ATTENTION, l'hélicase avance par contre toujours de droite à gauche ça ne change pas)
Entre temps, l'hélicase aura continué à avancé vers la gauche donc,
les deux brins parents auront été un peu plus séparés. Une nouvelle amorce va devoir être synthétisée en arrière (c'est à dire plus à gauche) pour que l'ADN polymérase resynthétise une nouvelle portion d'ADN (si tu veux elle progresse en faisant à chaque fois un bond en arrière, puis en repartant dans le même sens, c'est-à-dire de gauche à droite).
Au final, "pour une synthèse de l’autre brin (tardif) qui respecte le sens 5’-3’, la réplication progresse dans l’autre sens à partir de plusieurs amorces. La polymérase ajoute les dNTPs à une première amorce puis recule et recommence au fur et à mesure" (phrase du diapo).
En moyenne la polymérase synthétise des fragments d'environ 200 nucléotides (fragments d'Okazaki) avant de faire un bond en arrière et de repartir dans le même sens, jusqu'à ce qu'elle rencontre l'amorce précédente!
Est-ce que ça t'aide ?