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Techniques quantitatives

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Techniques quantitatives

Messagepar Macroglossie » 13 Avr 2018, 16:11

Salut, :wink2:

Dans le récapitulatif de la ronéo 3 page 12 de l'an dernier le prof n'évoque pas le DPNI associé au NGS dans les techniques quantitative mais uniquement la PCR en temps réel,
Du coup si un qcm nous demande de donner les techniques quantitative permis la liste de technique vu dans les 3 cours on doit compter juste la PCR temps réel, le NGS si associé à un DPNI et faux le NGS "standard" ?

Merci d'avance! :soldier:
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Re: Techniques quantitatives

Messagepar Nom_de_Zeus! » 13 Avr 2018, 22:18

Hey ! :D

Alors je t'avouerai que sur le coup je comprenais pas trop où tu voulais en venir :mrgreen:

J'ai regardé dans la ronéo et ta confusion vient du fait qu'il y est écrit clairement que le NGS est une méthode quantitative dans ce cas (et je suis moyen fan de cette formulation parce que c'est plus un raccourci qu'autre chose, c'est pour ça qu'il fallait regarder la magnifique fiche de notre centre de téléchargement :desire:)

En fait peu importe la manière dont il est utilisé, le NGS n'est pas une méthode quantitative, on n'appellerait pas ça du séquençage haut débit mais du dosage haut débit à ce moment là, le NGS est une méthode qualitative utilisée à but quantitatif dans le cadre d'un DPNI :glasses-nerdy:

Déjà parce que contrairement à la qPCR = PCR quantitative = PCR en temps réel on va séquencer des mini portions de nucléotides pour aligner les fragments sur une séquence de référence, cette méthode est basée sur un séquençage (incomplet certes) mais n'utilise pas un dosage optique pour déterminer la quantité de matériel génétique, on se sert bien du principe du séquençage de manière détournée !

De plus le NGS te permet de détecter un chromosome surnuméraire, mais la quantification n'en est pas moins assez grossière et peu précise, en tout cas bien moins que la PCR en temps réel qui peut déterminer sans ambiguïté une charge virale ou en tout cas une quantité de matériel génétique, là on sait juste qu'il y a une sur-représentation chromosomique mais c'est tout, ce n'est vraiment pas précis pour déterminer une quantité !

Retiens que le NGS est vraiment une technique de séquençage qui peut être détournée en une application à but quantitatif, mais qui n'est pas quantitative en elle-même (d'où le fait que la prof ne le mette pas en tant que tel dans le schéma récap)

C'est bon ? :)
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Re: Techniques quantitatives

Messagepar Macroglossie » 14 Avr 2018, 08:31

Super c'est nickel merci! :highfive:
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