Gel analytique

[cam'cam]

Coucou ! Alors dans le gel analytique j'ai du mal à faire la différence entre "séquence lu sur le gel" et "séquence ADN à séquencer". Pourquoi on obtient une séquence différente alors que c'est le même gel ?

Merci d'avance

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Justement parce que la séquence ADN à séquencer n'est pas sur le gel on ne la fait pas migrer, d'où son nom

Tu fais uniquement migrer sur le gel les fragments ayant incorporé des ddNTP lors de l'étape de réplication, en se servant du brin codant comme matrice (qui a été répliqué après PCR)
Ces fragments correspondent donc à la séquence complémentaire de celle du patient qui est codante et qui nous intéresse donc, la séquence lue sur le gel est ainsi complémentaire du brin codant du patient, c'est-à-dire de la séquence ADN du patient à séquencer !

C'est pour ça qu'on doit chercher la séquence complémentaire de celle lue sur le gel pour obtenir par complémentarité la vraie séquence du patient qui nous intéresse !

Retiens que :
- séquence lue sur le gel = succession de ddNTP lue de bas en haut sur le gel et en fonction du puits de migration où se situe le fragment

- Séquence ADN à séquencer = séquence complémentaire de celle lue sur le gel qui correspond à la séquence codante du patient

C'est plus clair ?

[cam'cam]

Okok du coup si on nous demande la séquence d´ADN du patient on peut pas la lire sur le gel, comment on fait du coup ?

Merci beaucoup en tout cas, et surtout de la rapidité de la réponse ?

[Nom_de_Zeus!]

C'est ce que je viens de te dire et c'est exactement le concept du qcm 4 du dernier tutorat, tu lis normalement ta séquence sur le gel, tu appliques ensuite le principe de complémentarité des bases pour toute la séquence que tu as obtenue lorsque tu l'as lue sur le gel et ensuite logiquement tu obtiens une nouvelle séquence, et bien cette séquence est celle du patient qui t'intéresse !

Je peux pas être plus clair là