Détail NGS

[Sachacetabulum]

Hello !

Dans la fiche sur le NGS, partie "Evolution des techniques", il est écrit :

On a réussi à séquencer 95% du génome humain en 2001, ce qui
représente le séquençage de 30 000 gènes (soit 3 milliards de pb) !
Ce séquençage a commencé en 1989 pour s’achever en 2003.

Et, plus généralement, ce chiffre de 95% est répété à plusieurs reprises...

Ma question est la suivante pourquoi ce n'est pas 100%, puisque l'on parle de séquencer entièrement le génome ?

Bon j'avoue que c'est pas une question essentielle, mais ça m'intrigue un peu quand même

Merci d'avance !

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Bon déjà ce n'est évidemment pas du tout une question essentielle et on s'en fout totalement

En fait il y a une petite subtilité : on a bien séquencé la totalité du génome soit 100%, mais si tu as bien suivi en biomol avec les enseignements du Grand Maître de la Base Azotée, tu as appris qu'il existe des régions dupliquées, on retrouvera donc la même séquence en double !

Ces régions représentent 5% de notre génome total et étant donné qu'elles ont strictement la même séquence au nucléotide près que d'autres portions (vu que ce sont des duplications #c'estlogique), elles n'apparaîtront pas sur le résultat final du séquençage, l'appareil de séquençage fera comme si ces portions qui sont bel et bien "en plus" et font partie intégrante du génome ne sont que des reads, des copies en plus d'une seule et même région !

Au final n'apparaîtront que les séquences différentes les unes des autres, soit 95% du génome, sans prendre en compte les régions dupliquées !

C'est bon ?

[Sachacetabulum]

D'accord ! Oui, j'avais un peu oublié ce passage là du cours de Naïmi

Merci pour ta réponse et pour le CCB !