extraction ADN plasma

[bananablaste]

Coucou!
A la dernière page de la nouvelle ronéo il est dit que, pour les extractions d'ADN, on compte faux le plasma car le DPNI n'existait pas. Je ne comprends pas pourquoi on ne peut pas extraire l'ADN a partir du plasma.
Merci

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Non ce n'est pas ce qu'il y a écrit dans la ronéo, il faut distinguer ADN circulant (fœtal dans le cadre d'un DPNI) et ADN génomique

C'est la troisième année que la prof fait un cours sur le NGS, avant ça dans les QCM concernant l'extraction d'ADN (que ce soit fœtal circulant ou génomique) on comptait faux le plasma car le séquençage haut débit n'était pas suet a fortiori le DPNI non plus

Aujourd'hui on compterait le plasma vrai (d'où le fait que j'ai réactualisé la correction des annales) car chez tout individu on peut extraire des petits fragments d'ADN circulant (il y a de l'ADN fœtal circulant chez une femme enceinte que l'on peut utiliser pour un DPNI mais aussi chez une femme qui n'est pas enceinte ou chez un homme on retrouve des petits fragments du propre ADN du patient en circulation dans son plasma qu'on peut utiliser pour diagnostiquer précocement un cancer par exemple, ça s'appelle une biopsie liquide mais ça ne fait pas partie de votre programme)

Avec le NGS, on peut travailler à partir du plasma pour étudier l'ADN circulant du patient, mais qui ne représente qu'une fraction limitée de tout son matériel génétique, on ne retrouve pas d'ADN génomique dans le plasma (cela supposerait que le matériel génétique soit non fragmenté et surtout complet ce qui n'est pas le cas on ne retrouve pas tout le génome d'un individu dans son plasma seulement des tout petits bouts insuffisants pour faire du séquençage)
Si on veut travailler avec de l'ADN génomique on a toujours besoin d'extraire le matériel du noyau des cellules, notamment des leucocytes, le plasma ne nous est d'aucune utilité

Au final, retiens que :
- Avant le NGS (plus au programme donc) le plasma ne servait à rien car il ne contient pas d'ADN génomique et on ne pouvait pas exploiter l'ADN circulant

- Maintenant (à retenir pour cette année) le plasma permet d'extraire l'ADN circulant du patient grâce au NGS mais si on veut récupérer de l'ADN génomique (autrement dit un génome complet) on a toujours besoin de cellules nucléées

Attention à la nuance

[bananablaste]

D'acc merci