Recoucou
Non la ce n'est pas totalement similaire.
Alors d'une part : le prof précise
uniquement le maltose dans le cas de l'amidon je suis d'accord l'amylose est un enchaînement de glucose lié en alpha (1-4) et le glycogène est aussi constitué de glucoses liés en alpha (1-4)...
Mais vraiment retiens que l'amylose est spécifique de l'amidon et qu'on ne peut pas parler d'amylose pour le glycogène.
Pourquoi ? Alors je pense que la raison est la suivante mais
c'est totalement du hors programme :
Alors certes: on trouve deux structures similaires correspondant à des enchainements de glucose liés de façons alpha (1-4)
mais pourquoi parle-t-on uniquement d'amylose pour l'amidon ?
En fait : c'est parce que le prof fait
une simplification en fait
l'amylose est certes un enchainement de glucose mais contrairement à ce que dit le prof
ce n'est pas vraiment une structure linéaire à proprement parler. 
Elle s'organise en fait
en hélice α, avec des tours de spire composé d'un nombre précis de résidus de sucre (8 au maximum). 
Donc
l'amylose en soi n'a pas de branchement mais n'est pas réellement une structure linéaire
mais plus hélicoïdal.

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Alors qu'en fait: dans le
glycogène certes tu as également des glucoses en liaison alpha (1-4) mais
cette fois je pense que la structure est vraiment linéaire et n'a pas ce système d'hélice.
Donc : même si tu as le même type de liaison et à priori le même type de structure,
tu n'as pas ce système hélicoïdal propre à l'amylose ( et donc propre à l'amidon)
tu ne peux donc pas parler d'amylose dans le glycogène !! 
Voilà j'espère avoir répondu à ta question
