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Messagepar Dr.Chopper » 17 Sep 2019, 07:14

Salut :)
C'est plutôt un post de vérification errata des ronéos AA, Protéines (Au passage les ronéos sont TOP :clap: )

Quand on parle de la structure secondaire on ne parle pas encore de structure tridimensionnelle même si on à des repliements dans l'espaces ?
De plus quand on parle de AA alpha es ce qu'on fait référence au carbone asymétrique ou pas ? Du coup suivant cette logique la glycine n'est pas un AA alpha ?

Désolé je fais un post rassemblement sur la ronéo des AA/protéine, par rapport au groupement chargé aux extrémité de la liaison peptidique, il s'agit seulement de groupement N-terminal (alpha amine) et C-terminal (alpha carboxylique) ou on peut avoir N-terminal (alpha carboxylique) et C-terminal (alpha amine)

Petit passage un peu WTF si c'est par rapport à la visualisation ou on l'apprend comme ça (structure primaire) "les chaînes latérales des acides aminés sont des substituants à cette épine dorsale"

Petite contradiction entre profs du coup si on peut poser la question directement au prof : "La séquence de l’enchainement des acides aminés est unique pour chaque protéine" Or en biomol on dit que le code génétique est dégénéré cad plusieurs codons spécifient le même AA donc on peut avoir différent enchainement d'acides aminés pour une unique protéine

Diapo 76: "dans protéines globulaires (structure compacte!): 1/3 des aa dans coudes permettant la chaîne de changer de direction" Je trouve que ça n'a pas de sens, c'est pas plutôt 1/3 des AA des protéines globulaires codent pour des coudes B permettant de changer de direction"

Petite incohérence par rapport à la méthode d'électrophorèse: On nous dit que plus une molécule est grande plus elle capte de SDS chargé - et plus elle migre vers l'anode selon le sens de migration dirigé vers le bas mais après dans le résultat de notre échantillon quand on regarde la masse en KDa elle est croissante en haut alors que logiquement les protéines avec une plus grande masse moléculaire serai en bas :question:
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Re: Structure AA

Messagepar lisaa_arnd » 23 Sep 2019, 13:14

+1 pour le fait que la phrase sur les 1/3 d’acides aminés n’a pas trop de sens, mais oui je pense aussi que ça veut dire qu’un tiers des acides aminés dans les protéines globulaires sont impliqués dans des coudes bêta
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Re: Structure AA

Messagepar Dr.Chopper » 26 Sep 2019, 19:38

+1
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Re: Structure AA

Messagepar Dr.Chopper » 05 Oct 2019, 13:38

UP :neutre:
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Re: Structure AA

Messagepar Dr.Chopper » 22 Oct 2019, 13:15

Ça commence à faire un moment là :question:
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Re: Structure AA

Messagepar Maëstro » 22 Oct 2019, 17:27

Coucou alors je pensais avoir répondu déjà à ce post, je croyais que c'était un doublon ...
Et Dr Chopper les remarques de ce type ne sont pas les bienvenues, nous faisons dans tous les cas ce que nous pouvons, parmi les 630 posts en biochimie que nous avons il arrive que certains passent à la trappe, oui nous ne sommes pas des machines, ..et même les machines ça plante ..!

Quand on parle de la structure secondaire on ne parle pas encore de structure tridimensionnelle même si on à des repliements dans l'espaces ?
-> Si on parle déjà de structure tridimensionnelle

De plus quand on parle de AA alpha es ce qu'on fait référence au carbone asymétrique ou pas ? Du coup suivant cette logique la glycine n'est pas un AA alpha ?
-> Non pas forcément alpha et asymétrique c'est différent, et la glycine n'a pas de carbone asymétrique mais bien un carbone alpha

Désolé je fais un post rassemblement sur la ronéo des AA/protéine, par rapport au groupement chargé aux extrémité de la liaison peptidique, il s'agit seulement de groupement N-terminal (alpha amine) et C-terminal (alpha carboxylique) ou on peut avoir N-terminal (alpha carboxylique) et C-terminal (alpha amine)
-> non N terminal amine C terminal carboxylique

Petit passage un peu WTF si c'est par rapport à la visualisation ou on l'apprend comme ça (structure primaire) "les chaînes latérales des acides aminés sont des substituants à cette épine dorsale"
-> vois le peptide comme une tige et les chaîne latéral des aa de ce peptide comme les épines qui sont dirigées vers le haut ou le bas

Petite contradiction entre profs du coup si on peut poser la question directement au prof : "La séquence de l’enchainement des acides aminés est unique pour chaque protéine" Or en biomol on dit que le code génétique est dégénéré cad plusieurs codons spécifient le même AA donc on peut avoir différent enchainement d'acides aminés pour une unique protéine
-> la séquence d'aa sera la même par contre

Diapo 76: "dans protéines globulaires (structure compacte!): 1/3 des aa dans coudes permettant la chaîne de changer de direction" Je trouve que ça n'a pas de sens, c'est pas plutôt 1/3 des AA des protéines globulaires codent pour des coudes B permettant de changer de direction"
-> envoie la diapo mais ça ne me choque pas ..
Petite incohérence par rapport à la méthode d'électrophorèse: On nous dit que plus une molécule est grande plus elle capte de SDS chargé - et plus elle migre vers l'anode selon le sens de migration dirigé vers le bas mais après dans le résultat de notre échantillon quand on regarde la masse en KDa elle est croissante en haut alors que logiquement les protéines avec une plus grande masse moléculaire serai en bas :question:
->non car ce sont les plus petites qui migrent plus loin
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