Wolfram

[BatBouut]

Salut,

On dit que dans le syndrome de wolfram je ne connais pas la mutation... on cherche a séquencer la totalité du génome! C’est une errata ?
Roneo1 page 12

Merci d’avance ❤️

[Lilou Sanger]

Salut
Non ce n'est pas une errata, la prof le dit bien il me semble
Enfet je pense qu'elle veut dire que dans le cas d'un variant d'épissage, donc dans une région intronique, on ne voit pas la mutation lorsqu'on séquence les exons ou lorsqu'on cherche une mutation "classique" comme par exemple dans la famille A en exemple qui sont des mutations qu'on connait et dans des régions exoniques
Donc on va devoir séquencer tout le génome dans le cas de la mère de la famille B car on n'a rien trouve dans les régions exoniques et que l'enfant est atteint (alors que c'est une patho à transmission récessive)

[BatBouut]

je pense que les NGS séquence que les région codante... je crois que la prof s'est trompé à l'oral
parce que dans ce cas la le qcm 5 des annales 2016 item B devient vrai.. mais la correction dit non :

QCM 5 : A
A) Vrai : d’après l’énoncé on est dans le cas où on a plusieurs mutations qui existent sur un seul gène. Même si la mutation est ici dominante, ce cas clinique ressemble à celui du syndrome de Wolfram du cours avec le gène WFS1. En effet vous avez vu que pour ce syndrome il existe plusieurs mutations possibles du même gène et que pour identifier la mutation causale, il faut faire un séquençage des régions codantes du gène en première intention !
B) Faux : utilisé pour rechercher plusieurs mutations dans plusieurs gènes
C) Faux : utilisé pour rechercher une mutation ciblée très précisément définie, et on ne sait pas si la mutation que l’on recherche ici est sensible à une éventuelle digestion par EcoRI. De plus on ne connait peut-être pas toutes les mutations de ce gène donc même si une enzyme de restriction peut détecter la présence d’une de ces mutations, elle ne fonctionnerait que si cette mutation précise est présente. Si notre patient ne l’a pas, on peut juste éliminer cette mutation mais il en resterait de nombreuses autres à tester ce qui nous ferait perdre énormément de temps. Le plus logique est donc de séquencer les exons pour identifier directement la mutation ! On ne demande pas à identifier une mutation en particulier mais on cherche à identifier le gène responsable.
D) Faux : l’item est faux à cause du « direct » : il y a en effet une amplification par PCR nécessaire avant de pouvoir séquencer quoi que ce soit !
E) Faux

[Lilou Sanger]

Coucou !
Oui une NGS classique ne séquencera que les régions codantes
Mais pour le syndrome de Wolfram quand on cherche une mutation intronique, on va utiliser la transcriptase inverse pour avoir aussi les introns☺️ C’est un cas particulier où on cherche à séquencer les introns

[BatBouut]

Merci ❤️