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La régulation de la trnascription


La régulation de la trnascription

Messagepar yoram » 27 Nov 2008, 22:33

Un petit problème avec la partie sur la régulation de la transcription :

-Le complexe d'initiation (proximal) est formé de l'ARN polymérase et des GTFs (facteurs de transcriptions généraux) niveau de la TATA BOX. C'est quoi l'histoire des facteurs protéïques, des activateurs et tout ?
-Le complexe distale c'est le ehanceur et les silencer, mais ils sont formés de quoi ?
-Où interviennent les autres facteurs de transcription (dits spécifiques) ?
-Enfin, Gilson considère que les éhancers et silencer agissent à distance ou par une boucle de l'ADN? (Il me semble avoir entendu au cours à distance (à confirmer... c'était dur ce cours :roll: ) et apparement sur internet ils disent que c'est une boucle.

Ca a du être un casse-tête chinoix pour les ronéoïstes qui ont ordonné tout ca ... merci pour les réponses !
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Messagepar Brice » 27 Nov 2008, 23:24

yoram a écrit:-Le complexe d'initiation (proximal) est formé de l'ARN polymérase et des GTFs (facteurs de transcriptions généraux) niveau de la TATA BOX. C'est quoi l'histoire des facteurs protéïques, des activateurs et tout ? -Où interviennent les autres facteurs de transcription (dits spécifiques) ?

3 élément st nécessaires pr aboutir à l'expression d'1 gêne:
=> 1)le cx d'initiation
=> 2)les fr de transcription (Je pense que ce st ceux-ci que tu qualifies de "spécifiques"?) ( = prot qui se fixent au niv de la région promotrice + prot qui se fixent à des prot appelées coactivatrices)
=> 3)le cx médiateur (qui permet la comm entre les fr de transcription et le cx d'initiation)
En gros 2) et 3) stabilisent le cx d'initiation qui, fixé seul à la TATA box, est instable.
(Je sais pas trop si je rep à ta q° là ms bon j'aurai essayé????)

yoram a écrit:-Le complexe distale c'est le ehanceur et les silencer, mais ils sont formés de quoi ?

Il s'agit de petites séquences d'ADN.

yoram a écrit:-Enfin, Gilson considère que les éhancers et silencer agissent à distance ou par une boucle de l'ADN? (Il me semble avoir entendu au cours à distance (à confirmer... c'était dur ce cours Rolling Eyes ) et apparement sur internet ils disent que c'est une boucle.

Ouais moi aussi j'ai entendu qu'il agissaient à distance, mais je ne me souviens pas qu'il ait parlé de boucle de l'ADN...
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Messagepar NutCrack3r » 28 Nov 2008, 10:04

le complexe de d'initiation: c'est la TATA box avec ARNpolymérase et les six facteurs généraux de transcription (GTFs).
La TATA box est une séquence d'ADN contenant les séquences nécessaires à l'initiation de la transcription ainsi que sa régulation.
L'ARNP II ne se lie pas directement à l'ADN et elle n'est pas capable non plus d'initier la transcription et de repondre aux protéines de régulation, donc elle nécessite la coopération avec les facteurs généraux de transcription, les GTFs (nbr de 6)
L'ensemble: TATA box + ARNP II + GTFs = complexe d'initiation


Ils existent arès des facteurs de transcription dit "spécifique"= protéine qui régule quantitativement la transcription qui se situent au niveau du promoteur distal.
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Messagepar yoram » 28 Nov 2008, 10:11

Super c'est clair maintenant, merci !

Une petite question supplémentaire : Le médiateur relie directement cx d'initiation et facteur de transcription ou c'est simplement co-activateur et cm d'initiation ? (Sur le texte c'est le 1er cas et sur le schéma c'est le deuxième).
Le nombre de QCM qu'on peut avoir la-dessus ...

@Brice : Promis, la prochaine fois je degarde à gauche et à droite avant de tourner à droite :lol:
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Messagepar NutCrack3r » 28 Nov 2008, 11:29

pour faire simple: le facteur médiateur est un facteur qui permet a l'ARN polymérase de ce lier au facteur de nucléation qui est sur la TATA box

facteur de nucléation: reconnaissance d'une sequence spécifique au niveau de la TATA box
facteur médiateur: il associe à la séquence spécifique de TATA box à ARNP II

en réalité, y a les facteurs de transcription généraux qui interviennent dans tout cette assemblage. Si tu veux plus d'information dit le moi et jte resume ou du moins essaie de te resumer tout ca! :wink:
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Messagepar yoram » 28 Nov 2008, 11:38

Aaaah ! J'avais rien compris alors ! Le facteur médiateur va donc seulement stabilisé l'ARNP sur le facteur de nucléation.
Avant, les facteurs de transcription généraux avait permis la fixation de manière instable de l'ARNP sur le facteur de nucléation et enfin les co-activateurs vont se fixer sur le complexe d'initiation et le médiateur pour stabiliser encore plus le tout.

Une fois qu'on a tout ca, le complexe d'initiation est assez stabilisé pour commencer la transcription basale :idea: :idea: !
Promis je t'offre des roses à la fin de l'année !
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Messagepar NutCrack3r » 28 Nov 2008, 12:21

On reprend du tout début! :D

La transcription nécessite d'une ARN polymérase (ARNP)
La portion de l'ADN qui est transcris en ARN par l'ARNP porte le nom d'Unité de Transcription (UT)

L'ARNP doit etre guidée vers sont UT, ce guidage se fait par l'intermédiaire d'un promoteur de transcription.

Le promoteur est une portion d'ADN qui se trouve à proximité de l'UT ou à l'intérieur de l'UT
(si le promoteur est a l'interieur il sera transcrit alors que si il est a proximité il ne le sera po! po tres important pour le moment :lol: )
Le promoteur c'est la portion d'ADN qui contient des séquences neccessaire à l'initiation de la transcription et a sa régulation.
pr initiation de la transcription: le promoteur doit etre reconnu par l'ARNP.

au ARNP ne se lie pas directement à l'ADN et n'est pas capable seule d'initier la transcription donc a besoin de la coopération des facteurs généraux de la transcription.

maintenant que les notions sont mises en place... pour l'ARNP II

- initiation de la transcription: c'est l'assemblage du complexe d'initiation:
1°) sur la TATA box (seq spé du promoteur) , fixation de TFII D
TFIID joue le role de facteur de nucléation. Il contient une sous unité, TBP qui reconnait la TATA box.

2°) les complexes TFII A et TFII B s'asocient ensuite.
TFII A est un facteur additionnel qui permet un bonne liaison entre TFIID (le facteur de nucléation) et TATA box.
TFII B est le facteur médiateur c'est lui qui va s'associer a TBP et va permettre a ARNP II de s'associer a l'ensemle.

3°) TFII B recrute ARNP II via TFII F (ARNP II est tjs associé à TFII F qui est un facteur additionnel, il permet a ARNP II de reconnaitre le facteur médiateur)

4°)puis recrutement de TFII E et TFII H

L'ensemble forme le complexe d'iniatiation inactif.

5°) TFII E active TFII H (facteur tres important dans le demarrage de la transciption)
TFII H possède deux activités:
- une activité hélicase lui permettant d'ouvrir la double hélice; et
- une activité kinase qui va lui permettre de phosphoryliser le domaine C-terminal (CTD: domaine ayant un role clef ds l'initiation de la transcription)) de l'ARNP II.
Cette phosphorylation permet l'activation du complexe d'initiation et la synthèse des premiers nucléotides.


- cette etape d'iniation de la transcription sera suivie d'une étape d'elongation puis de terminaison!


pour ce qui est de la régulation de la transcription:
tu as des facteurs de transcritption dit spécifique qui regulent quantitativement la transcription, ils influencent soit directement la transcription, soit indirectement par l'intermédiaire de corégulateurs transcriptionnels.

Les enhancer et silencers sont des portions d'ADN de gde taille, leur localisation peut etre en amont et en aval de l'UT mais aussi à l'interieur.


et voila !! :wink: :D
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Messagepar NutCrack3r » 28 Nov 2008, 12:22

si certaines notions reste un peu floues!!
no soucy tout ceci sera repris avec la biomol!! :wink:
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Messagepar pitchoun » 20 Déc 2008, 17:46

c'est a savoir genre
TFII A est un facteur additionnel pk il les a nommée pour moi en cours mais il les a pas " decrit" pk ca je me souviens de l'avoir fait en biomol de meme epissage avec maturation tete queu supression de certaine partie ...

bref on l'a pas vraiment vu non ???
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Messagepar Maddy » 01 Jan 2009, 18:16

euh.. est ce que ces noms sont à connaitre FII.. pck sa me dit vrmt rien.. :§
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Messagepar boubou le sage » 01 Jan 2009, 19:07

non tu verra apré en bio mol
a cœur vaillant rien d'impossible.....
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