J'ai vu qu'il y a déjà eu pas mal de questions sur ce genre de QCMs, désolée d'en rajouter une couche mais je ne suis pas sure de comprendre.
Selon le DM annales :
QCM 5 : Vous souhaitez réaliser un diagnostic moléculaire à partir d'un prélèvement sanguin. A partir de quel(s) constituant(s) sanguin(s) allez-vous extraire l'ADN génomique ? Donnez-la ou les réponse(s) exacte(s)
A) Le sérum
B) Les globules rouges
C) Les leucocytes
D) Le plasma
E) Les propositions A, B, C et D sont fausses
QCM 5 : ACD
Confirmé par la prof. Ce QCM est tombé au CC quand il n’y avait encore aucun cours sur le NGS, la réponse était alors uniquement C. Je suis allé parler à la prof, qui m’a dit que depuis que le séquençage haut débit est au programme, la réponse à ce genre de questions doit bien évidemment changer et qu’un éventuel énoncé sur ce point du cours serait très précis au concours pour éviter des ambigüités...
A) Vrai : Le sérum est la phase aqueuse du sang (obtenu après coagulation) ; il ne contient certes pas les cellules du sang mais il contient tout de même de l’ADN circulant de l’individu (il n’y a en effet pas que l’ADN foetal circulant qui peut être retrouvé dans le sang d’une femme enceinte, nous avons tous des fragments de notre ADN qui circulent en quantités infimes dans notre sang mais que l’on peut très bien récupérer pour faire diverses séries d’analyses de biologie moléculaire, c’est un des enjeux majeurs en biopathologie aujourd’hui !
B) Faux : Les globules rouges ne possèdent pas de noyaux, donc pas d’ADN
C) Vrai
D) Vrai : Le plasma est la phase aqueuse du sang (obtenu sous anticoagulant après centrifugation du sang) ; il ne contient pas les cellules du sang mais de l’ADN circulant cf. A)
E) Faux
Or, en 2017, pour un QCM du même genre, on a :
QCM 4 : Vous recevez en consultation une famille dans laquelle se transmet une maladie autosomique dominante. Le gène XYZ est connu pour être responsable des signes cliniques présentés par les différents membres de cette famille. Plusieurs mutations dans les différents exons de ce gène ont déjà été décrites. Quelle(s) est(sont) la ou les méthode(s) que vous pouvez utiliser pour rechercher la mutation causale dans ce gène chez un patient de cette famille ?
A) Le séquençage direct de l’ADN génomique extrait à partir des globules rouges du patient
B) Le séquençage des produits PCR correspondants aux régions codantes du gène
C) Le séquençage des produits PCR correspondants aux régions codantes du gène obtenus à partir du prélèvement plasmatique du patient
D) Le séquençage des produits PCR correspondants aux régions non codantes du gène
E) Les propositions A, B, C, D sont fausses
QCM 4 : B
A) Faux : les globules rouges ne contiennent pas d’ADN
B) Vrai
C) Faux : une PCR-séquençage ne peut pas se faire à partir d’un prélèvement plasmatique car il y a trop peu d’ADN pour pouvoir en faire quoi que ce soit et une analyse quantitative n’a aucun intérêt ici on ne cherche pas à faire un DPNI ! De plus on recherche une mutation dans un gène ce qui correspondrait au cas d’une maladie monogénique comme le syndrome de Wolfram et la PCR-séquençage est la seule méthode indiquée en première intention contrairement au NGS réservé aux pathologies impliquant plusieurs gènes.
D) Faux : on ne séquence toujours que les régions codantes car on ne sait pas interpréter un variant situé dansune région non codante !
E) Faux
Est-ce que je dois en conclure que :
- Pour faire un diagnostic moléculaire, on peut extraire de l'ADN génomique à partir du sérum, du plasma, des leucocytes
- Mais pas pour la PCR car l'ADN serait en quantité insuffisante ?
Est-ce que tu pourrais récapituler un peu tout ça s'il te plait ?
Merci beaucoup et désolée pour la longueur de ma question
