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sanger + automate

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sanger + automate

Messagepar camcamnéus » 29 Avr 2020, 15:58

Salut !

J'ai une petite question concernant la méthode sanger, et les automates, dans la méthode sanger, on utilise la migration électrophorétique afin d'analyser le résultat, cependant, il est dit par la suite que la méthode automatisée utilise également le gel, mais j'ai une incompréhension car on parle des séquenceurs automatiques & d'une analyse informatique.
Donc il faudrait "découper" cette partie en 3 ? Du type Sanger + Sanger automatisée = migration sur gel /// séquenceurs = analyse info ?

Merci d'avance <3
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Re: sanger + automate

Messagepar Lilou Sanger » 30 Avr 2020, 12:53

Coucou !
Alors la prof nous avait dit par rapport à un de nos qcm qu'on lui avait envoyé : "La méthode dite automatisée est basée sur le principe de la méthode Sanger, le terme automatisé fait appel aux séquenceurs capillaires qui utilisent un laser pour identifier les ddNTPs fluo. Donc en résumé, la méthode de séquencage Sanger est la réaction de séquence qui utilise des ddNTPs, soit radiomarqués ( 1ère méthode mise en place), soit fluorescents ( utilisés aujourd'hui avec les séquenceurs automatiques " méthode automatisée" )
Dans les deux cas c'est du séquençage selon la méthode de Sanger. "

Donc enfet que ca soit un séquençage Sanger ou automatisé, les deux utilisent la méthode de Sanger avec les ddNTPs, et une migration éléctrophorétique
La différence ca sera que pour la méthode automatisée, ca sera une caméra qui détectera les couleurs des ddNTPs fluorescents (et donc leur identité par code couleur etc) , et qu'on obtiendra les résultats par traitement informatique ( donc l'enchainement dde nucléotides), alors que la méthode Sanger c'était une interprétation visuelle du gel, et non informatique( ca devait pas exister à l'époque aha)

Du coup y'a deux moyens de séquencer qui reposent sur la même méthode, les deux utilisent la migration sur gel & la méthode automatisée utilise des séquenceurs automatisés et une analyse informatique ;)

C'est bon pour toi? <3
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Re: sanger + automate

Messagepar camcamnéus » 30 Avr 2020, 13:48

Salut ! Parfait pour la réponse tu m'as tout bien expliqué merci beaucoup <3
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Re: sanger + automate

Messagepar Lilou Sanger » 30 Avr 2020, 19:31

De rieeen ! Bon courage <3
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