Amplification

[SnDrPnHr_]

Coucou,

(Je m’excuse d’avance pour ce long post)

Dans la partie sur le NGS, pour l’amplification de façon clonale, j’arrive pas bien à comprendre les sous parties.
Cette étape dépend des technologies : (en gros)
- Ilumina : capture des fragments
- Roche : billes d’agarose + PCR par émulsion
- Ion Torrent : sphère métallique

Et du coup en suite,
- petit 1) la préparation des échantillons et on parle de la méthode Par capture -> Illumina
- petit 2) PCR par émulsion -> Roche
- petit 3) purification des sphères -> Ion Torrent

Je crois que j’ai pas compris un truc 😅 Je sais pas si on amplifie selon les 3 technologies (donc on doit faire toute les étapes cités) ou bien, on doit en faire qu’une seule des trois selon la technologie utilisé (et du coup la prof nous aurait expliqué les 3 technologies)

Merci de m’éclairer svppp ! 🙏🏼☺️

[Lilou Sanger]

Coucou !
C'est 3 techniques différentes, on n'utilise pas les 3 en même temps, con amplifie pas selon les 3 technologies
On en utilise qu'une, c'est donc la prof qui a expliqué les 3
C'est bon pour toi ?

[SnDrPnHr_]

Ouiiiii c’est ce que je voulais savoir ! Merci beaucoup ! 😚

[Lilou Sanger]

De rieeeen ! Bon courage 🤓

[SnDrPnHr_]

Re coucou !

En fait c’est toujours pas bon 😅😭

- Du petit c au e, c’est pour la technologie Illumina
- petit 2 avec micro réacteur et PCR en émulsion c’est pour la technologie Roche
- petit 3 purification des sphères, si on en croit la description faite en haut de la page 15, ce serait la technologie Ion Torrent, sauf que pour moi c’est la suite de la PCR en émulsion puisque ça nous permet de récupérer l’ADN que l’on souhaite séquencer par la suite. Du coup il n’y aurait pas la description de la technologie ion torrent.
Sauf que dans la description page 15, on utilise par des sphères métalliques mais des billes d’agarose.

Du coup, je comprends pas bien. Parce qu’en fait, j’ai l’impression que c’est qu’une seule technologie mais en même temps plusieurs.

Est ce que ce serait possible que tu me fasses un recap de ces parties pour que je m’y retrouve stp ?

Merci bcp d’avance ! 🙏🏼

[AnNévrisme]

Coucou

Je te met ici un super schéma simple et récap de la ronéo de l'année dernière :

Je pense qu'il devrait clarifier tout ça pour toi.
Si cependant certaines choses ne sont pas encore très claires n'hésite pas moi ou ma co-tut te répondront

[SnDrPnHr_]

Ah oui d’accord je vois mieux maintenant ! En fait dans la roneo, c’est pas écrit qu’avec Ion Torrent on fais aussi une PCR en émulsion. C’est beaucoup plus claire !
Merci beaucoup vous gérez !