annale 2016 qcm 1

[drgrey]

coucou
par rapport à ce QCM

QCM 1 : Pour rechercher une mutation à l’origine d’une maladie dans un gène connu, vous utilisez la technique du séquençage haut débit (NGS) par capture des régions d’intérêts. Dans l’ordre chronologique, quelles sont les principales étapes de cette technique ? Donnez-la (les) proposition(s) vraie(s) :
A) Une fragmentation de l’ADN génomique, la ligation des adaptateurs en 3’ et 5’ des fragments d’ADN génomique, une capture des régions d’intérêt, une amplification clonale par PCR, un séquençage
B) Une fragmentation de l’ADN génomique, une ligation des fragments d’ADN dans un vecteur, une amplification par PCR, un séquençage
C) Une extraction d’ARN, la production d’un ADN complémentaire (ADNc), un clonage moléculaire dans un vecteur, une amplification par PCR, un séquençage
D) Une amplification clonale par PCR, une digestion enzymatique par une enzyme de restriction, un séquençage
E) Les propositions A, B, C, D sont fausses

(réponse A)
je ne comprends pas pourquoi B et C sont fausses
certes on a skip des étapes mais c'est toujours dans l'ordre chronologique non ?
merci

[AnNévrisme]

Coucou,

Désolée ton post a été un peu enseveli

Alors non il n'y a bien que la A de juste.
Attention à ne pas confondre les différentes techniques.

B) Une fragmentation de l’ADN génomique, une ligation des fragments d’ADN dans un vecteur, une amplification par PCR, un séquençage

-> ici on te parle de vecteur on est donc dans un clonage qui se suivra ensuite par un séquençage donc c'est un clonage moléculaire (et non un suivi de la protéine comme ça aurait été le cas pour un clonage d'expression)

C) Une extraction d’ARN, la production d’un ADN complémentaire (ADNc), un clonage moléculaire dans un vecteur, une amplification par PCR, un séquençage

->on te parle clairement de clonage on est donc pas du tout dans les étapes de la NGS

Ce qu'il faut bien comprendre c'est que :
Même si les différentes techniques peuvent être utilisées à la suite pour un même patient (comme dans l'exemple du patient Wolfram avec site cryptique) ses techniques sont bien différentes :à la fois dans leur but et leur déroulement du coup les unes des autres et peuvent être utilisées séparément ++ !

Est ce que c'était ce point là qui t'as fait poser le problème ou tu as besoin d'un petit recap sur les étapes de la NGS ?

[drgrey]

ok c'est bon j'ai compris, merci beaucoup c'est super clair