NGS ADN ou ARn

[Etudiant11]

Bonjour, lors de la présentation du matériels nécessaire au NGS on nous parle uniquement d’ADN génomique. Cependant dans la liste des différentes applications du NGS on peut lire l’analyse des ARN (RNA-seq, détermination niveaux d’expression, identification épissage alternatifs). D’où ma question : peut on réaliser un NGS à partir d’ARN en le séquençant directement ou faut-il passer par un ADN complémentaire ? et dans les 2 cas ça voudrait dire qu’on n’utilise pas uniquement de l’ADN Génomique du coup j’ai l’impression qu’il y a une contradiction dans le cours.
Merci en avance pour votre aide.

[Nucléodrey]

Hello,

Alors la plupart du temps on évite au maximum d'utiliser de l'ARN car il est beaucoup plus instable et donc plus difficile à utiliser.

Si toutefois on doit vraiment utiliser de l'ARN on passe par un étape de reverse transcriptase pour obtenir l'ADN correspondant (équivalent de l'ADN génomique)

Bonne soirée
Audrey

[Etudiant11]

D’accord merci, donc un item du style « on peut utiliser de l’ARN lors d’un NGS » serait faux ?

[TriPhosphatE]

Un item comme ça ne serait pas assez précis car on peut mais de manière INdirecte en faisant une reverse transcriptase pour obtenir de l'ADNcomplémentaire ou ADNc.

[Etudiant11]

Ok merci beaucoup