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N,C-term?


N,C-term?

Messagepar loul » 19 Sep 2009, 16:11

Coucou, j'essaye de comprendre la biochimie (non sans difficulté :/) mais je bug sur le N-term et le C-term que je ne comprends pas ...Du coup l'exopeptidase m'échappe complètement :S

Merci pour votre aide =)
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Re: N,C-term?

Messagepar liloune1412 » 19 Sep 2009, 16:26

Je ne suis pas tutrice mais je crois que les N-term correspondent aux termes avec NH3 et les C-term ceux avec COOH.
Donc pour l'exopeptidase, tu coupe a droite des N-term et à gauche des C-term.

Je me comprend mais je sais pas si ce que j'ai été très comprehensible. ^^.

La réponse d'un tuteur sera plus claire je pense lol.

Bye
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Re: N,C-term?

Messagepar Ludo. » 19 Sep 2009, 16:29

Quand tu shématises une protéine, par ex :
V-A-T-Y-A-C-M

par convention :
- l'aa situé à gauche a sa fonction amine libre car non engagée dans une liaison peptidique => l'extrémité N-term est donc située à gauche
- l'aa situé à droite a sa fonction carboxyle libre car non engagée dans une LP => l'extrémité C-term est donc située à droite.

Je pense que tu peux plus facilement comprendre comment agissent les exopeptidases 8)
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Re: N,C-term?

Messagepar loul » 19 Sep 2009, 17:03

Merci =) :wink:

En faite, si j'ai bien compris, pour une proteine P-I-L-E en faisant une AMINOPEPTIDASE et en prenant la :
- leucineaminopeptidase on obtient P-I/-L/-E
- l'aminopeptidase on obtient P/-I/-L/-E/
Et en faisant une CARBOXYPEPTIDASE A on obtient P-/I-/L-E la CARBOXYPEPTIDASE B ne change rien à cette proteine.

Je ne sais pas si j'ai bien employé le vocabulaire :s

Merci beaucoup de prendre le temps de nous répondre :D c'est génial !
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Re: N,C-term?

Messagepar Ludo. » 19 Sep 2009, 17:44

peptide : P-I-L-E

- avec la LeucineAmino Pase => ATTENTION rien ne se passe ici car on a une proline en N-term !! et on ne peut pas couper apres le I puisque c'est le 2éme aa
- Aminopeptidase M => on obtient 4 aa
- CarboxyPase A ou B => RIEN ne se passe !!
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Re: N,C-term?

Messagepar loul » 19 Sep 2009, 18:16

Ok :oops: ...pourtant dans le poly il est écrit que la carboxipeptidase A coupé Ala, ile, leu et val à gauche des C-term :? du coup je comprend pas pourquoi elle n'a aucun effet sur ce peptide..

Désolé d'insisté c'est le week-end lol enfin pas pour les P1 je pense :roll: =)
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Re: N,C-term?

Messagepar Ludo. » 19 Sep 2009, 19:17

carboxypeptidase A coupe a gauche de A, I, V, L
donc pour P-I-L-E elle peut pas couper a gauche de E...
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Re: N,C-term?

Messagepar loul » 19 Sep 2009, 20:49

oki merci =)
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