immunoprécipitation

[Thib]

salut,

j'ai lu un post que margaux a fait en septembre sur l'immunoprécipitation, ce qui m'a permi d'en comprendre un peu plus (mais pas assez encore ) sur cette expérience.

Cpdt, un terme reste mystérieux pour moi (même si ça devrait pas ): qu'est ce que le promoteur??

merci d'avance

[Margaux]

Coucou,

Bon, pour l'immunoprécipitation, j'ai fait des erreurs dans l'explication que tu as lue ^^", donc il faudrait que je reprenne ça maintenant que le prof l'a réexpliquée.

Et un promoteur est une séquence d'ADN située en amont (5') d'un gène dont il initie et régule - en partie - la transcription.
La boîte TATA par exemple appartient au promoteur et fixe le complexe d'initiation de la transcription.
Mystère élucidé ?

[Thib]

je crois :

donc ca correspond au complexe de préinitiation dont parle le proffesseur naïmi en biomol et ça comprend TATA box,médiateurs (co activateurs et répresseurs) ADNpol2 et GTFs mais pas les TF c'est ça?

[Thib]

...gloups je la refais:

c'est une séquence d'ADN sur laquelle se fixent tous les trucs que j'ai cité mais du coup j'ai un autre pb:

la tatabox est une séquence d'ADN sur laquelle se fixent les médiateurs
donc la tatabox est une partie de la séquence d'ADN du promoteur...?

[Margaux]

Alors, pour la régulation proximale:
Oui, la boîte TATA est une partie de la séquence d'ADN du promoteur.
Et c'est sur la boîte TATA que se fixe le complexe d'initiation (ARN polymérase II + facteurs généraux de transcription GTFs).

Pour réguler la transcription, on a besoin de facteurs de transcription FTs:
- qui peuvent se fixer au niveau de la partie proximale du gène, en amont de la séquence promotrice. Dans ce cas-là, l'intervention d'un complexe médiateur est nécessaire.
- ou qui peuvent se fixer sur les éléments du complexe d'initiation, auquel cas pas besoin du complexe médiateur.

Des éléments co-activateurs (histones acétyl-transférases par exemple) ou co-répresseurs (histone désacétylases) vont aussi venir jouer leur rôle.

Et plus loin, on trouve une régulation distale avec les enhancers (= stimulent la transcription), les silencers (= inhibent la transcription) et les insulateurs (= limitent la zone d'action des enhancers et silencers).

On est bons ?

[Thib]

là on est parfaits j'osais pas te demander le topo^^
si avec ca je reprend 8 au prochain tut c'est que j'suis vraiment pas doué
merci!

[Margaux]

Mais il ne faut pas hésiter à demander ! On est là pour ça, au pire, on mettra un peu de temps à te répondre.
- J'étais sûre que quelqu'un voudrait un topo. ^^ -

Et pas de souci à te faire, ça arrive à tout le monde de se louper de temps en temps au tut' (à la limite, on retient même mieux là où on s'est trompé -_-").