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différentes formes de R et K


différentes formes de R et K

Messagepar 123 » 10 Oct 2010, 21:10

Bonjour,

je me prends la tête sur les différentes formes de R et K :? , en effet je pense avoir plutôt bien compris la méthode mais lorsque je le fait pour R et K je trouve que deux formes sur quatre ont une charge nette de +1 et les deux autres de 0 (= gros problème...!) car pour moi puisqu'ils sont basiques, ils vont gagner un H+ sur leur NH2 lors de l'ionisation:
<2,3: NH3+ COOH NH2 =+1
2,3-pka de la chaine latérale: NH3+ COO- NH2 =0
pka de la chaine latéral-9,6: NH3+ COO- NH3+ =+1
>9,6: NH2 COO- NH3+ =0
Donc: help les tuts!!! :roll:

Merci beaucoup!! :mrgreen:
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Re: différentes formes de R et K

Messagepar WatiGG » 11 Oct 2010, 16:00

K, et R sont basiques.

On a donc 3 valeurs de pKa pour chacun de ces acides aminés.

•pKa ~ 9,3 pour l'extrémité N-term qui se charge + à pH physiologique. Elle est sous forme protonée à pH compris entre 0 et 9,3. Donc NH3+ entre 0 et 9,3 et NH2 entre 9,3 et 14.

•pKa ~ 2,3 pour l'extrémité C-term qui se charge - à pH physiologique. Il est sous forme protonée à pH compris entre 0 et 2,3. Donc COOH entre 0 et 2,3 et COO- entre 2,3 et 14.

•pKa "bonus" qui dépend de la chaîne latérale. On a ici des AA basiques donc qui ont une forme NHx+ à pH physiologique.

Ce qui donne sur ces molécules dotées de deux fonctions basiques (N-term et Chaîne latérale) :

une charge +2 (les deux fonctions basiques sont protonées et chargées +, ainsi que la fonction acide qui sera neutre) à pH proche de 0

une charge -1 (les deux fonctions basiques sont déprotonées donc neutres, ainsi que la fonction acide qui sera chargée -) à pH proche de 14.

une forme isoélectrique dépendant du pKa de la chaîne latérale.


J'espère que j'ai répondu à ta question,
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Re: différentes formes de R et K

Messagepar 123 » 11 Oct 2010, 17:31

oui merci beaucoup!! et j'ai compris aussi avec les planches de notre cher raymond...! :mrgreen:
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