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FRET intermoléculaire


FRET intermoléculaire

Messagepar -Tagada- » 14 Avr 2021, 18:39

Bonjourrr! :D

J'ai fait beaucoup de recherche sur le fofo et j'ai trouvé ce sujet https://www.carabinsnicois.fr/phpbb/vie ... ET#p680117 mais je ne comprends toujours pas le principe...

En fait si, je comprends comment le FRET fonctionne, mais je ne comprends pas comment interpréter l'expérience du cours qu'il présente comme un "exemple d'application du fret intermoléculaire" (p.3 de la ronéo). Je ne comprends ni les valeurs des longueurs d'ondes, ni le spectre... Est-ce que ce serait possible de m'expliquer comment est-ce qu'on analyse ce type d'expérience point par point?

Merci d'avance!! :coeur:





(PS: Je sais qu'il y a déjà un sujet qui s'appelle comme ça mais il concerne l'intrAmoléculaire alors que moi c'est intEr du coup j'ai remis le même nom :confused: )
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Re: FRET intermoléculaire

Messagepar El Sangliero » 14 Avr 2021, 19:08

Salut Adada4 !
Alors je vais essayer de détailler un maximum et tu me diras si c'est bon ou s'il faudrait que je reformule !
On a 2 molécule (NIPP1 et PP1) dans la cellule et on ne sait pas si elles sont proches, si elles interagissent ensemble...

:arrow: On va donc associer à chacune de ces protéines 1 fluorochrome, on aura alors :
CFP-NIPP1 :arrow: on associe de la CFP à NIPP1. La CFP est excité par un photon de longueur d'onde d'environ 430nm et aura une longueur d'onde d'émission autour de 470nm
YFP-PP1 :arrow: on associe de la YFP à PP1. YFP est excité par un photon de longueur d'onde d'environ 470-500nm et aura une longueur d'onde d'emission autour de 530nm

:arrow: Donc la longueur d'émission de la CFP est dans le spectre d'absorption de la YFP ! et on sait (principe sur lequel repose le FRET), que si 2 fluorochromes dont l'un a un spectre d'émission superposable au spectre d'absorption de l'autre, alors ces deux fluorochromes pourront interagir si ils se trouvent à moins de 10nm ! (un peu lourd comme phrase désolée)
En clair : si le CFP est assez proche de YFP et que le CFP est excité alors l'énergie émise par le CFP après excitation ira exciter à son tour le YFP ! (finalement c'était censé être plus clair mais ça l'est pas tellement)

:arrow: Par conséquent, si on excite notre cellule avec une longueur d'onde de 430nm, et qu'on observe ensuite une longueur d'onde de 470nm, on peut déduire que le CFP a été touché, mais pas le YFP ! Le CFP et le YFP sont donc éloignés de plus de 10nm, NIPP1 et PP1 sont donc éloignés de plus de 10nm, donc ces deux protéines n'interagissent pas ensemble !
:arrow: Si on excite notre cellule avec une longueur d'onde de 430nm, et qu'on observe ensuite une longueur d'onde de 530nm, on peut déduire que le CFP a été touché, a émis à 470nm, ce qui a excité la YFP qui a alors émis à 530nm !
Le CFP et le YFP sont donc éloignés de moins de 10nm, NIPP1 et PP1 sont donc éloignés de moins de 10nm, donc ces deux protéines interagissent ensemble !

Je reviens pour la suite dans 2 minutes ! :jallaisdire:
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Re: FRET intermoléculaire

Messagepar El Sangliero » 14 Avr 2021, 19:12

Je crois que j'ai compris d'où vient le problème, les longueurs d'ondes données dans l'exemple du cours ne coïncident pas parfaitement : 476 ≠ 510 !

Mais le truc c'est que ce n'est pas une longueur d'onde tout pile qui va exciter un fluorochrome, on a un "spectre d'absorption" et un "spectre d'emission" donc c'est plutot "excité entre x et y" et "émettra entre W et Z" !

J'ai trouvé sur un papier d'ARPEGE, des spécialistes des analyses fonctionnelles et structurales des complexes protéiques (je fais la meuf mais j'ai juste cherché sur google pour illustrer le plus justement mon propos, mais du coup je site ma source), des courbes montrant les faeux spectres de la CFP et de la YFP je te les mets ici ça peut peut-être t'aider à visualiser !

Voilà je sais pas si ça t'aide dis moi si j'y suis pas du tout !
Bonne soirée ! :jallaisdire:
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Re: FRET intermoléculaire

Messagepar -Tagada- » 15 Avr 2021, 19:00

Aaaaaaaaa mais d'accord je vois!!!!! Je comprenais rien j'essayais d'additionner les longueurs d'onde etc mdrr maintenant j'ai compris! Il fallait juste que je regarde les données de la courbe mais comme je comprenais rien ca ne m'aidait pas :lol:

En tout cas maintenant tout est clair grâce a ton beau post en couleur (et très agréable à lire)!
(Ça m'a fait une illumination :in-love: )

Merciiiii beaucouppp :coeur:
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Re: FRET intermoléculaire

Messagepar El Sangliero » 15 Avr 2021, 21:04

Ah je suis ravie que ça t’ai aidé j’ai eu peur de m’être un peu emballée mdrr !
Bon courage pour la fin du semestre ! :jallaisdire: <3
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Re: FRET intermoléculaire

Messagepar -Tagada- » 16 Avr 2021, 09:03

Non non tkt c'était super!

Merci beaucoup!! :coeur:
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