Les protéines transmembrannaire

[whahh]

Bonjour !

Je sais que les protéines transmembrannaires ont 2 zones hydrophiles et 1 zone en alpha hélice hydrophobe .
Cependant,j'ai une source qui affirme : le peptide signal est une séquence protéique, située a l'extrémité Nt, constituée d'AA dont une série d'AA apolaires formant une alpha hélice capable de s'insérer dans un feuillet mbR .

J'ai appris que dans une protéine transmembrannaire, la région hydrophobe était au "milieu" ..
Et la ça me gène, car je pensais que si on avait des AA apolaires => hydrophobes
polaires => hydrophyle. Et je sais aussi que l'extrémité Nt est normalement hydrophile constituée d'AA polaire, donc ça m'embête qu'ici elle l'extrémité Nt ai des AA apolaires ..

Je sais pas si je suis clair, mais bon ..

Merci d'avance !

[-Alexis]

Salut whahh !

Alors, après m'avoir donné mal à la tête, je crois avoir compris ton soucis! ^^
Bon, blagues mises à part, tu as raison sur toute la ligne et je pense qu'il te manque un élément pour comprendre la contradiction que tu mets en évidence :

Effectivement le peptide signal est bien constitué d'acides aminés hydrophobes. En fait, la traduction de ton ARN en protéine débute dans le cytosol, là on se retrouve avec un peptide signal et ton bordel moitié protéine/moitié ARN va aller sur une membrane. En fait le peptide signal va être reconnu par la membrane et va la traverser (forcément puisqu'il est hydrophobe!) Se peptide signal va ensuite être clivé et la protéine va continuer à être traduite à travers la membrane.

Voilà, alors j'ai énormément simplifié pour ne faire que répondre à ta question sans partir dans des trucs de dingue. Si c'est pas clair, n'hésite pas et dis-le moi, je pousserai dans les détails que Gilson va vous donner lorsqu'il vous fera cette partie du cours.

A bientôt !

[whahh]

Désolé pour ton mal de tête ^^..
et merci pour ta réponse rapide !
Mais y'a quelque chose qui me pose problème : le peptide signal j'ai vu qu'il était a l'extrémité de la protéine, et que NORMALEMENT, l'extrémité d'une protéine transmembrannaire est hydrophile, non ? ? Ou alors, hydrophile mais pas au niveau du peptide signale ?

Désolé de t'embeter ..

Merci encore !

[-Alexis]

Ben en fait, l'extrémité de la protéine transmembranaire est hydrophile une fois que le peptide signal a été clivé. Après le clivage la protéine n'a plus le peptide signal à son extrémité donc tout ton domaine qui n'est pas inclu dans la membrane et qui se situe à la fin de ta protéine est bien hydrophile ! Voilà

[whahh]

Super . Merci beaucoup, et excuse pour le dérangement !

Bye !

[-Alexis]

Pas de problème Whahh ! On est là pour ca !