Endo/exopeptidase

[Weegun]

Bonsoir, une petite question avant d'aller me coucher ^^
Je voudrais savoir si les endopeptidases sont capable de lyser les prot au niveau de leurs extrémités N et C ou si elle sont uniquement capables de lyser au milieu donc à au moins 1 aa de l'extrémité.

Autrement dit ^^ si j'ai un peptide MANGER

Il sera lysable par la carboxypeptidase B puisqu'il a une arginine en extrémité C-term on est d'accord sur ce point là, mais est ce que la trypsine sera aussi capable de le lyser ou est ce qu'elle va reconnaitre le fait que R est à une extrémité et donc elle n'agira pas ??

Merci d'avance pour vos réponses ;D

[vavouille]

Ben déjà ta trypsine elle coupe à droite de R et K et comme dans "MANGER" à droite du R ya plus rien ... Ben elle va rien couper
Plus sérieusement, il me semble que les endopeptidases coupent leurs acides aminés peu importe où ils sont dans ton peptide, donc même si ils sont aux extrémités ça coupe quand même !

[marquito]

Saloute,
Si on prend ta protéine à l'envers : REGNAM, et si on me dit d'utiliser la trypsine sur cette prot je couperais la première arginine. Donc je pense que c'est oui, car y'a pas de différence entre les liaisons peptidiques des acides-aminés. Et comme la justement fait remarqué vavouille sur MANGER ça marche pas .

[Weegun]

Oui c'est vrai que ça coupe à droite dsl ^^ mais bon vous avez compris le but de ma question quand même ma question xD
Merci

[attention83]

Bonjour,

C'est peut être une question bête mais je ne vois pas la différence entre une endopeptidase et exopeptidase.
Si quelqu'un peut méclairer ce serait cool.

Merci d'avance
Bonne soirée

[Zhost]

endo : en dedans.
exo : à l'extérieur, aux extrémités.

Endopeptidase : coupe tout ce qui peut se trouver à l'intérieur d'un peptide.
Exopeptidase : coupe l'AA en Nterm ou l'AA en Cterm.

Exemple avec le pepetide suivant : VOICIUNEXEMPLESYMPA

Ton Nterm = V
Ton Cterm = A
Tes endopeptidases coupent entre le V et le A.
Ta carboxypeptitase A qui est une exopeptidase coupant à gauche de V, A, L, I séparera l'alanine en Cterm du reste du peptide.
ATTENTION : ta carboxypeptidase A ne peut pas couper en Nterm !! Pourquoi ? Parce qu'à gauche du V.... bah y a pas d'aminoacids.

Voili.
A+

[attention83]

Merci beaucoup pour ta réponse, maintenant c'est bien clair