[Resolu] Structure des protéines

[Cocorico]

Bonjours,
1 même séquence peut se retrouver dans des structures secondaires et tertiaires différentes.
Je ne comprend pas cela ... ^^
Merci beaucoup !!

[jgei]

Ben c'est tout simple: imagine tu as la liaison Arg-Hys-Va , qui est une liaison fictive ^^
Cette chaine peut etre utilisé dans le cadre d'une protéine donné (ex: immunoglobuline) mais aussi dans une autre protéine qui aura un role tres différent (ex: oestradiol): car pour les deux protéines, il faut impéretivement cette séquence pour qu'elles fonctionnent et ce sont les autres séquences qui seront associées à celle ci qui donnera à tes protéines un role différent ^^

Voila, je ne sais si c'est correct, ou meme si c'est la réponse que tu attendais

[Cocorico]

Cette explication me semble juste, du moins cela m'éclaire !! ^^
Merci beaucoup !

Et aussi tant que j'y suis dans le diapos il y a marqué que pour le coude beta il n'y a jamais d'aa apolaire pourtant il y a une Proline en position 2 et la proline est un aa apolaire ... :/

[jgei]

Ca par contre je sais pas du tout
Je pense que la Proline est indispensable pour réaliser la coudée, mais apres t'expliquer le pourquoi du comment j'en suis incapable...

Je te conseil d'attendre qu'un tuteur passe par la, car ce conseil me servira aussi

[Cocorico]

Haha bon ben on attend alors !!
Merci beaucoup en tout les cas !

[jgei]

Mais de rien, ce fut un plaisir

[-Andrea-]

salut !

je vous renvoie a ce post d'alistair très complet

viewtopic.php?f=333&t=23366

[Alistair]

Pour le fait qu'une mêle structure primaire puisse se retrouver dans des structure secondaires différentes, je te renvoie à ce post : viewtopic.php?f=333&t=23384
Regarde mon "4)", il répond à ta question

[Cocorico]

Ok alors pour la Proline c'est super clair !! Merci beaucoup !! et excusez moi je n'avais pas vu que la question avait déjà été posé .. :/ Je regarde a chaque fois pourtant ..

Par contre pour le 4) je n'ai super bien compris .. Parce que en fait, pour moi la structure secondaire et tertiaire c'est la même protéine, alors je comprend pas comment c'est possible que ses structures soient différentes, elles le sont oui parce que l'une représente des modifications 3D et l'autre juste des modifications local, mais c'est liée ... Je sais pas si je suis clair ... :/

[Cocorico]

J'ai également une nouvelle question, concernant les glucides,
Il est dit que la cyclisation est du au groupement carboNyle, c'est bien carboNyle ou c'est plutôt carboXyle ...
Et si c'est bien carboNyle, qu'est ce que c'est ? Merci beaucoup !!

[Cocorico]

En fait je suis presque sur que c'est bien carboNyle vu que ce terme revient plusieurs fois ! ^^
Par contre j'ai une autre question, est ce que c'est possible d'avoir un cétose avec une fonction aldéhyde ?
Je suis désolée de poser toutes ses questions ... :/

[Alistair]

Alors ^^:

- Prend un structure primaire donnée (enchainement d'AA). Selon la manière dont cette chaine va être maturée, prise en en charge, etc il va y avoir la formation de structures secondaires différentes.
Par exemple, si une chaine est prise en charge par des protéines chaperonnes (ce sont des prots qui aident à la maturation des protéines), ces protéines chaperonnes peuvent forcer la chaine a former des hélices alpha ou des feuillets en pliant la chaine de telle ou telle manière, en ajoutant des sucres sur certains AA ce qui change l'affinité entre certains AA etc. Si la même chaine n'est pas du tout prise en charge, elle peut adopter des structures secondaires très différentes car rien ne l'aura forcé à se plier etc...
A partir du moment ou tu as des structures secondaires différentes, ça va se répercuter sur la structure tertiaire : tu ne pourras pas faire exactement la même protéines globulaire par exemple.

En bref, en voyant une structure primaire seulement, tu ne peux pas dire : on va avoir telle ou telle structure secondaire et tertiaire à plus forte raison ! Selon le parcours de la protéine (comment sa maturation se fait, selon la temprérature, le pH,...), une séquence d'AA pourra être impliquée dans une hélice, un feuillet ou même ni l'un ni l'autre ! C'est logique : il ya tellement de combinaisons de liaison H et ioniques possibles entres les AA d'une prot...
En encore plus bref : une séquence primaire n'est pas spécifique d'une structure secondaire ! (même si elle l'influence c'est certain !)

- Un carbonyle c'est un groupement qui désigne un Carbone lié à un Oxygène par une double laision. Ce Carbone ne porte (outre l'oxygène doublement lié) que des C ou des H. ça donne :

200px-General_struct_ketone_group.png (2.78 Kio) Vu 568 fois

ou

C'est un terme générique pour désigner les Aldéhydes (RCHO) et les Cétones (R1R2CO)

- un carboxyle c'est aussi un C lié à un O par une double liaison mais le C est lié à un 2ème O et à un R (chaine de carbone)
C'est la fonction acide carboxylique COOH (et ester COOR)

- Dans les monosaccharides, on n'a que des Carbonyles (Aldéhydes et Cétones)

- Non dans un Aldose tu n'as qu'un aldéhyde en C1 et dans un cétose tu n'as qu'une cétone en C2 ou ailleurs !
Mnt tu peux modifier les sucres et oxyder des fonction alcool en cétone ou aldéhyde... Mais ce sont des modifications donc on ne parle plus de cétose ou d'aldose !

[Cocorico]

Oui d'accord je comprend ! C'est clair maintenant ! Je suis désolé de poser tant de questions ... ^^
Merci beaucoup de prendre du temps pour me répondre !
Heureusement que vous etes là, vous les tuteurs !

[Angèle.A]

Bonsoir, je voudrais savoir pourquoi la proline fais partie des AA avec chaines" aliphatique", alors que la proline comporte un cycle ? Aliphatique ne signifie pas sans cycle ?

[_NiNa_]

Bonsoir Angèle,
Je ne pense pas que "Aliphatique" signifie acyclique, car on peut très bien avoir des AA aliphatique cyclique ou acyclique : comme tu le voit c'est la cas de la Proline.

[Alistair]

Slt ! Alors pense à créer un nouveau sujet quand tu poses une question ! Surtout si elle n'a pas de rapport avec le sujet initial !

La définition de chimie organique du mot aliphatique n'est pas l'absence de cycle !
Un composé aliphatique est un composé non aromatique : soit linéaire soit cyclique ! Ex : un cyclohexane ou encore le cycle dans la proline !

Passe une bonne soirée

[Angèle.A]

Je pensais que ca avait un rapport puisque c'était sur les structures des proteines le sujet ! Désolé . Merci pour la reponse !

[Alistair]

Ne t'inquiète pas c'est pas grave ! bonne soirée