Alors voilà une cellule mutante est une cellule qui est passée dans une zone dite "fukushimante" ou "tchernobiante". Il faut donc que tu visualise cette cellule comme une aberration qui est capable de former un complexe enzymatique TCR qui pourra ensuite realiser une réaction unique complexe au sein de la partie mutée donc ayant subi des radiations ce qui a eu pour conséquence de modifier la séquence dont les sequences consensus indispensables à la transcription qui ne se fera donc pas et qui empechera la traduction et donc de former d'autres enzymes. Cependant les enzymes TCR peuvent proliferer et donner des clones dans l'appareil de golgi trans ou cis. C'est un phenomene vraiment très importante à ne surtout pas négliger!! Le prof n'en a pas beaucoup parlé je comprends donc que tu n'aies pas compris. Il faut vraiment que tu saisisse ce que je viens de t'expliquer car les cellules mutantes ont un role essentiel par rapport aux proteines endogenes qui ne sont autre que les protéines presentes et tranduites meme en cas de mutation. Il faut donc que l'enzyme PA-T puisse s'associer avec la un O (oxygene) et un U (uracile). Ce qui nous donne un complexe PA-T-O-U qui est un complexe enzymatique très important. C'est un complexe surjectif mais qui peut aussi avoir un role bijectif ou dans cetains cas ( plus rare) injectif.
L'XPA est capable de reparer car il a dans sa composition un isomere du PAT-O-U donc il peut agir d'une maniere analogue et realiser une reaction enzymatique complexe de reparation au sein du genome de la cellule mutante. Lorsqu'on introduit le gène hybride avec XPA avec la séquence normale mutée et DFP, si cette introduction est suffisante pour réparer l'exposition aux UV, dans ce cas on peut dire que le gène EGFP-XPA est fonctionnel donc on en deduit qu'il se passerai la meme chose avec GFP et une non mutée.
Néanmoins, certains antigènes des protéines endogenes sont de nature peu immunogène (molécule de petite taille, protéine endogène, protéine présentant de fortes homologies avec des protéines de l’hôte,…), il est alors difficile de générer une réponse immune et des anticorps. Diverses stratégies sont couramment utilisées pour contourner le manque d’immunogénicité : utilisation de stratégies d’immunisation sophistiquées ou développement de banques d’anticorps recombinants. Ensuite, il n’est pas acquis que l’anticorps obtenu, bien que spécifique de l’antigène, reconnaisse spécifiquement la protéine choisie.
Confrontés à ces difficultés sur des antigènes traditionnellement problématiques, le Dr Antelme a mis en place une theorie interessante. Cette théorie est la suivante: "Par comparaison avec des données expérimentales, spécifiquement obtenues dans ce but à l'IRAMIS/SPAM, il est possible de sélectionner la meilleure méthode ab initio, permettant de fixer les paramètres de modèles dits de "champ de force", pour reproduire fidèlement la structure d'assemblées d'atomes aussi complexe que celles constituant les protéines (macromolécule constituée d'acides aminés) ou les peptides (petits polymères d'acides aminés, n<50)."
Voilà j'espere que cela t'as aider. Bon courage pour la suite et n'hesite à me contacter si tu as encore besoin d'aide
pour tes questions j'ai pas encore regardé la ronéo mais : une protéine endogène c'est une protéine destinée à rester dans le corps, dans l'organisme, contrairement à exogène qui veut dire "à l’extérieur", c'est tout bête 
