Salut salut
Deja désole du retard de réponse mais ton post c'étais passé en résolu ducoup je ne l'avais pas regarder!
Ducoup c'est parti, on va revoir toutes c'est petites définitions pour que ce quoi bien clair!
Alors un composé
hydrophile, c'est un composé qui est
soluble dans l'eau, qui va venir se dissoudre dans l'eau (comme le sel par exemple).
Ca s'oppose à un composé
hydrophobe qui est un composé qui est
pas soluble dans l'eau, qui va venir se dissoudre (comme l'huile).
Ok donc une molécule/un composé va avoir des
caractéristiques hydrophiles ou hydrophobes en fonction des liaisons qu'il est capable de faire.
- Le composé
hydrophile va être capable de faire plein de
liaisons avec son solvant (genre il va grave bien s’intégrer et son fondre dans la masse ), ducoup il sera soluble. Il va venir faire des
liaisons hydrogène et ionique.
- Le composé
hydrophobe ne viendra
pas faire de liaison avec son solvant (on va revoir apres pourquoi), ducoup il sera non soluble. Ducoup il fera des
liaisons hydrophobe mais PAS avec le solvant, avec les autres molécule qui sont dans le même cas que elle ( genre toute tes molécules d'huile elles se lient pas avec le solvant mais entre elles).
Maintenant pourquoi est ce que une molécule fait un certain type de liaison ? -> ca va dépendre de la
composition de la molécule.
- Si la molécule possède des
groupements ionisables ( amine, alcool, acide carbo, cetone) elle sera apte a faire des
liaisons ioniques (pour ca faut des charges complètes) et des
liaisons hydrogènes. 
Alors la
liaison hydrogène c'est une liaison entre 2 molécules ( on va prendre 2 molécule d'eau H20, regarde le shéma en bas)
-> la liaison va se faire entre la
charge partiel positive de l'Hydrogène d'une molécule1 et la charge partiel négative de l'oxygène de la molécule 2. (Les charges partiels apparaissent du à une différence d'éléctronégativité mais tu le revera++ en chimie o donc si tu as des question vaut mieux que tu leur demandes à eux, ils t’expliqueront mieux que moi!)
- Au contraire si la molécule na
pas de groupement ionisable (imagine un alcane juste une petite chaîne carbonée), elle ne pourra
pas faire de liaison ionique ou hydrogène (vu quelle à pas de charge partielle ou de charge complète) du coup elle viendra faire des
liaisons hydrophobes. 
La
liaison hydrophobe c'est une
attraction préférentiel et non pas des forces de répulsion. En gros c'est pas que ta molécule hydrophobe et la molécule d'eau ce déteste mais que juste les molécules d'eau préfère faire des liaisons entre elles et les molécules hydrophobes préfèrent aussi faire des liaisons entre elles plus-tot que faire des liaisons eau---mol hydrophobe: c'est pour ca qu'on parle d'attraction préférentielle!
Ducoup si on applique tout ca à notre cours. On a des
AA qui en fonction de leur composition (groupement ionisable ou non) seront:
-
polaire (avec des charges partiels ou completes ) donc capables de faire des
liaisons hydrogènes et ioniques donc
HYDROPHILE-
apolaire ( sans charges) donc pas capables de faire des liaisons hydrogènes et ioniques mais ducoup capable de faire des
liaisons hydrophobes donc
HYDROPHOBEDucoup si tu prend une
protéine (suit avec le shéma), elle va être compose de AA polaire et apolaire, et quand elle va venir se
replier, (elle est intelligente) elle va venir placer:
- ces
AA polaire/hydrophile dehors/à l'exterieur de la proteine pour quelles puissent faire des
liaisons ioniques et hydrogènes avec le solvant - ces
AA apolaires/hydrophpobes vont se placer
dedans/à l'interieur de la protéine loin du solvant (vu quelle peut pas se lier avec) pour quelle puissent faire ces
liaisons hydrophobes avec les autres AA apolaires de la proteine. Ducoup à l'int de la proteine tu va retrouver une
poche hydrophobe.Ducoup une
poche hydrophobe c'est un regroupement
AA apolaire à l'int de ta proteine ou tu retrouves absolument pas d'eau/de solvant (la partie verte sur le shéma)
Voila c'etais long mais j'ai voulu bien refaire toute la reflexion avec toi j'espere que je ne t'ai pas perdu au passage, si tu as d'autres question hésites pas!
Bon travail et bonne journée!
