Roneo Biochimie N°8

[tommy640]

Bonjour tout le monde.

Déjà merci encore pour la ronéo qui est très bien faite (c'est vrai à chaque fois je viens me plaindre mais vous savez ce qu'on dit, l'arbre qui tombe fait plus de bruit que la forêt qui pousse (...)

Mais voilà, petit soucis.
Au niveau de la CPK, ça part un peu dans tous les sens à ce moment là :
"lorsque le niveau énergétique de la cellule est faible, la CPK2 peut être réorientée vers la mitochondrie" etc etc bilan : ça devient une CPK8

On venait pas de dire trois lignes plus haut que quand la cellule manquait d'énergie, la CPK2 hydrolysait la phosphocréatine pour donner de l'ATP ? Si oui, elle ne sera pas en même temps réquisitionnée vers la translocase?!

Donc soit en fait le bon mot c'était "niveau énergétique FORT", soit c'est plus complexe que ça (ce que je veux bien concevoir), soit j'ai rien compris (ce que je conçois tout à fait également).

J'attends vos lumières.
A bientôt.

[Sicko]

Bonjour tout le monde.

Déjà merci encore pour la ronéo qui est très bien faite (c'est vrai à chaque fois je viens me plaindre mais vous savez ce qu'on dit, l'arbre qui tombe fait plus de bruit que la forêt qui pousse (...)

Mais voilà, petit soucis.
Au niveau de la CPK, ça part un peu dans tous les sens à ce moment là :
"lorsque le niveau énergétique de la cellule est faible, la CPK2 peut être réorientée vers la mitochondrie" etc etc bilan : ça devient une CPK8

On venait pas de dire trois lignes plus haut que quand la cellule manquait d'énergie, la CPK2 hydrolysait la phosphocréatine pour donner de l'ATP ? Si oui, elle ne sera pas en même temps réquisitionnée vers la translocase?!

Donc soit en fait le bon mot c'était "niveau énergétique FORT", soit c'est plus complexe que ça (ce que je veux bien concevoir), soit j'ai rien compris (ce que je conçois tout à fait également).

J'attends vos lumières.
A bientôt.

Alors alors, j'ai essayé d'etre le plus clair possible dans la ronéo, mais c'est vrai que cette voie là n'est pas évidente à comprendre (d'autant que c'est la premiere que vous étudiez!)...

Il n'y a pas d'erreur, mais c'est en effet un poil plus complexe, je t'explique :

D'abord qd le travail débute la cellule musculaire se sert de la premiere réserve d'ATP dont elle dispose, à savoir le pool d'ATP de 10-4 mol/l qui se trouve ds le cytoplasme.

Mais ce pool d'ATP va vite (tres vite mm) etre épuisé.
L'idéal serait de disposer d'ATP en faisant marcher les voies cataboliques (tu dégrades des macro molécules comme du glucose et tu récupères de l'ATP en échange...tu reverras ces voies en détail)
Or ces voies cataboliques se mettent en place plus ou moins lentement, il faut un messager primaire, secondaire, un enchainement de réactions qui conduits à pleins de métabolites différents, et il faut ensuite rentrer dans la mitochondrie pour utiliser le cycle de krebs et la chaine respiratoire mitochondriale pour enfin avoir de l'ATP ...

Tout ça est très schématiquement expliqué, mais c pour que tu comprennes (sans trop t'embrouiller avec des dtails inutils) que ça prend du temps !

Du coup une autre réserve est utilisée : la créatine-P
Elle est présente dans la cellule déjà donc on a pas grand chose a faire si ce n'est d'utiliser la CPK-2 pour redonner de l'ATP a partir de cette créatine P et de l'ADP (qui est présent puisque la cellule vient dutiliser de l'ATP pour le travail musculaire, du coup t'as un max d'ADP et quasi plus d'ATP)

CréatineP + ADP ATP + créatine

donc là on est en période de TRAVAIL et de réserve ENERGETIQUE FAIBLE !
l'AK aussi participe a redonner de l'ATP mais bon ca c'est pas dans ta question donc je rentre pas dans les détails!

La réserve en CP s'épuise mais..

Les voies cataboliques fonctionnent enfin : t'as un max d'ATP tu continues ton marathon sans souci, bref t'es au také

Maintenant on change de contexte : tu viens de te taper un marathon t pas tout a fait dead mais t'es à bout de souffle, t'as des crampes : tu t'arretes !

Peu de temps après ça, tu te reposes : on est dans une nouvelle situation :
REPOS et niveau ENERGETIQUE FAIBLE

et là n'oublies pas : t'as plus de CP depuis perpette !
Donc le CPK-2 te sert strictement à rien!!

Par contre tu continues a dégrader du sucre (bon après un marathon jpense que tu démarre a dégrader de la graisse quand même ) : donc tes voies cataboliques fonctionnent.

Ellles fournissent de l'ATP, sauf quemaintenant l'intéret n'est pas de l'utiliser pour le travail mais bien de refaire des réserves d'énergie !
Donc tu passes a la CPK 8 qui va vers la translocase et transforme la créatine en CP grace a l'ATP qui en sort.

ATP + CREATINE CP + ADP

En même temps l'ATP est aussi utilisé par l'AK pour éliminer l'AMP (qui est un indicateur énergétique faible...or on veut justement passer à un niveau énergétique élevé) :

AMP + ATP 2ADP

l'ADP retourne a la mito se transforme en ATP grace aux voies cata et a la chaine resp mito et a la phophorylation oxydative...
Ainsi de suite jusqu'à retrouver un pool normal d'ATP cytoplasmique et de CP !

Donc en fait la phrase qui te pose problème est bien juste mais t'as pas fait gaffe au contexte de repos : il y a plus de CP donc on peut pas utiliser la CPK-2 (comme en periode de début de travail) ...

J'espère que ca va un peu mieux

[Momor]

ca c'est une belle réponse Fabien super tut!!

[boubou le sage]

trop fort si tu explik comme ca tt le pgme on va tous se gaver....tu gere

[Kiwicoco]

ouawww fafou t'es trop attentionné comme tut^^
franchement les P1, vous avez de la chance;)

[tommy640]

Belle explication, vraiment merci.

Malgré tout un léger détail me tracasse encore, quand on parle de niveau énergétique faible, on parle bien du rapport ATP/ADP ?

[Charlie]

Oui, tu peux faire l'amagalme entre un niveau énergétique et le pool d'ATP cytosolique, ou le rapport ATP/ADP...

Ceci étant, ça reste une notion très vaste, et le prof l'utilisera tout au long de l'année, il faut comprendre que toutes les voies métaboliques en biochimie seront basées sur ces notions de bioénergétique, c'est-à-dire que les voies seront orientées en fonction de ce "niveau énerdétique" de la cellule. Si je te parle d'amalgame c'est qu'au sens strict on désigne une quantité d'ATP, mais au sens large le professeur l'utilisera en faisant des raccourcis: Par exemple, il te dira "comme il y a beaucoup de glucose, la cellule est en niveau énergétique élevée et cherchera dégrader ce glucose". En réalité, il y a une légère nuance, la cellule dégrade ce glucose PARCE QU'elle est en niveau énergétique élevée, et elle voudra justement s'opposer à ça pour tendre vers un état d'équilibre.
Ce que j'ai essayé de t'expliquer n'est pas très pertinent, ça joue surtout sur les mots, mais dans ce contexte en bioch on a vite fait de remettre en question le pourquoi du comment ! Fin de la parenthèse

[tommy640]

Décidément j'vais vraiment être relou mais, peux-tu faire aussi un petit topo sur la liaison thioester quand l'envie t'en prend, parce-que l'explication de la RONEO (qui est cependant géniale, il faut le rappeler dans le contexte actuel, c'est malheureux d'ailleurs) est quelque peu hasardeuse sur CE point précis.

Merci

[Sicko]

Bein oui mais c'est pas très détaillé pq le prof l'a pas détaillé en fait

liaison thio ester : une fonction carboxylique associée à une fonction thiol SH

O-C-S-CoA

La fonction thiol provenant de l'acétyl CoA dans les voies cataboliques.
Ca va servir à activer une molécule, un Agras par exemple qui une fois fixé à du CoA via sa fonction carboxylique terminale va pouvoir subir les différentes réactions de son catabolisme (lipogénolyse)...
Vous reverrez tout ça

Cette liaison libère ds les 32 Kj

En gros jviens de te ressortir la ronéo, je sais , mais en mm tps c'est tout ce qui est à savoir pour le moment...

[las-vegas-parano]

mais ! My god c'est quoi ces Tut Bioch de feuu ^^ , on vous a promis une ristourne special ou quoi ^^ ? :p

[anaisb]

Oui, tu peux faire l'amagalme entre un niveau énergétique et le pool d'ATP cytosolique, ou le rapport ATP/ADP...

pourtant dans la ronéo y a écrit " la cellule utilise le rapport ATP / AMP pour savoir si elle est appauvrit ou enrichit"
est ce que c'est un erreur de la ronéo?
ou est ce que c'est ATP / ADP dans mitochondrie et ATP / ADP dans cytosol ?

[boubou le sage]

C'est l'AMP qui montre que la cellule est apauvrit, c'est un lapsus je penses....

[Sicko]

Oui le rapport ATP/AMP vaut pour le cytosol
Le rapport ATP/ADP vaut pour la mitochondrie.

Car l'activité de l'Adénylate Kinase dans le cytosol fait en quelque sorte perdre son "intéret énergétique" à l'ADP :
2 ADP ATP + AMP

La cellule ne s'embarrasse pas avec de l'ADP si elle peut faire de l'ATP, du coup elle utilise l'AK fait de l'ATP mais aussi de l'AMP en contre partie, et l'élément qui rend compte d'un appauvrissement énergétique cytosolique est donc l'AMP !

[Charlie]

Oui c'était une erreur de ma part !! On va surtout prendre en compte le rapport ATP/AMP parce que les finalités énergétiques seront souvent cytosoliques =)